2025/07/31 更新

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スギオ シゲトシ
杉尾 成俊
SUGIO SHIGETOSHI
所属
総合研究院 バイオメディカルAI研究ユニット 特任教授
職名
特任教授
外部リンク

学位

  • 薬学博士 ( 1985年3月   大阪大学 )

研究分野

  • ライフサイエンス / 構造生物化学  / 蛋白質結晶学、構造生物学、蛋白質科学、創薬科学

学歴

  • 大阪大学   大学院薬学研究科   薬品化学専攻

    1980年4月 - 1985年3月

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    国名: 日本国

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  • 東京理科大学   薬学部   製薬学科

    1976年4月 - 1980年3月

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    国名: 日本国

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経歴

  • 東京科学大学   総合研究院 バイオメディカルAI研究ユニット   特任教授

    2024年10月 - 現在

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  • 東京工業大学   科学技術創成研究院 バイオメディカルAI研究ユニット   特任教授

    2022年4月 - 2024年9月

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    国名:日本国

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  • 東京工業大学   科学技術創成研究院リサーチマネジメントオフィス   特任教授

    2016年11月 - 2022年3月

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  • 三菱化学株式会社   イオン交換樹脂事業部   事業部長付

    2016年4月 - 2016年10月

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    国名:日本国

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  • 三菱化学株式会社   黒崎事業所開発研究所イオン交換樹脂開発室   室長

    2012年4月 - 2016年3月

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  • 株式会社三菱化学科学技術研究センター   バイオ技術研究所   主幹研究員   グループリーダー

    2007年4月 - 2012年3月

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  • 横浜市立大学   大学院国際総合科学研究科   客員教授

    2006年4月 - 2016年3月

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  • ゾイジーン株式会社   構造解析事業部   事業部長

    2006年1月 - 2007年3月

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  • 京都大学   大学院農学研究科   非常勤講師

    2005年10月 - 2006年3月

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  • ゾイジーン株式会社   構造解析ビジネスユニット   主幹

    2005年5月 - 2005年12月

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  • 京都大学   化学研究所   客員助教授

    2003年4月 - 2004年3月

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  • ゾイジーン株式会社   構造解析グループ   グループマネジャー

    2002年1月 - 2005年4月

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  • 三菱化学株式会社   科学技術研究センター   主席研究員

    2001年4月 - 2001年12月

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  • 三菱化学株式会社   横浜総合研究所   主任研究員

    1997年4月 - 2001年3月

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  • 株式会社ミドリ十字   中央研究所   主任研究員

    1991年4月 - 1997年3月

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  • Brandeis University   Rosenstiel Basic Medical Sciences Research Center   Visiting Scientist

    1990年4月 - 1993年4月

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    国名:アメリカ合衆国

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  • 株式会社ミドリ十字   中央研究所   研究員

    1985年4月 - 1991年3月

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    国名:日本国

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所属学協会

  • 化学工学会

    2015年4月 - 2016年3月

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  • 米国蛋白質科学会

    2003年 - 2009年

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  • 日本蛋白質科学会

    2000年 - 2007年

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  • 米国結晶学会

    1992年 - 2004年

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  • 日本結晶学会

    1980年7月 - 現在

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  • 日本生物物理学会

    1980年7月 - 2020年3月

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委員歴

  • 宇宙航空研究開発機構 有人宇宙ミッション本部 宇宙環境利用センター   高品質タンパク質結晶生成WG委員  

    2013年 - 2016年   

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    団体区分:政府

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  • 日本学術振興会 産学協力研究委員会   量子ビーム融合化利用研究に関する先導的研究開発委員会幹事  

    2010年 - 2011年   

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    団体区分:政府

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  • 宇宙航空研究開発機構 宇宙環境利用センター JEM応用利用推進委員会   タンパク質結晶精製実験選定評価WG委員  

    2009年 - 2013年   

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    団体区分:政府

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  • つくば構造生物産業利用推進共同体   企業委員  

    2006年 - 2011年   

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    団体区分:その他

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  • 日本学術振興会 産学協力研究委員会 回折構造生物第169委員会   運営委員  

    2005年 - 2011年   

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    団体区分:学協会

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  • 蛋白質構造解析コンソーシアム   技術WG委員  

    2002年 - 2007年   

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    団体区分:その他

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  • SPring-8構造生物産業応用研究会   代表幹事  

    2000年 - 2002年   

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    団体区分:その他

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  • 兵庫県微小結晶構造解析技術研究会   幹事  

    1997年 - 2000年   

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    団体区分:自治体

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  • 日本結晶学会   編集委員  

    1996年 - 2000年   

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    団体区分:学協会

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  • 科学技術振興機構   ライフサイエンスの革新を目指した構造生命科学と先端的基盤技術領域 さきがけ領域アドバイザー  

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    団体区分:政府

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論文

  • Bioinformatic identification of cytochrome b5 homologues from the parasitic nematode Ascaris suum and the free-living nematode Caenorhabditis elegans highlights the crucial role of A. suum adult-specific secretory cytochrome b₅ in parasitic adaptation. 国際誌

    Shinzaburo Takamiya, Muneaki Hashimoto, Toshihiro Mita, Takehiro Yokota, Yoshitaka Nakajima, Fumiyuki Yamakura, Shigetoshi Sugio, Tsutomu Fujimura, Takashi Ueno, Hiroshi Yamasaki

    Parasitology international   65 ( 2 )   113 - 20   2016年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.parint.2015.11.004

    Web of Science

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  • Cloning and structure-function analyses of quinolone- and acridone-producing novel type III polyketide synthases from Citrus microcarpa. 国際誌

    Takahiro Mori, Yoshihiko Shimokawa, Takashi Matsui, Keishi Kinjo, Ryohei Kato, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Hiroyuki Morita, Ikuro Abe

    The Journal of biological chemistry   288 ( 40 )   28845 - 58   2013年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1074/jbc.M113.493155

    Scopus

    PubMed

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  • Crystal structure of GTPase domain fused with minimal stalks from human dynamin-1-like protein (Dlpl) in complex with several nucleotide analogues

    Hiroyuki Kishida, Shigetoshi Sugio

    Current Topics in Peptide and Protein Research   14   67 - 77   2013年

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Expression, purification and crystallization of an indole prenyltransferase from Aspergillus fumigatus. 国際誌

    Jing Chen, Hiroyuki Morita, Ryohei Kato, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   68 ( Pt 3 )   355 - 8   2012年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309112004964

    Scopus

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  • Arg305 of Streptomyces L-glutamate oxidase plays a crucial role for substrate recognition. 国際誌

    Tomohiro Utsumi, Jiro Arima, Chika Sakaguchi, Takashi Tamura, Chiduko Sasaki, Hitoshi Kusakabe, Shigetoshi Sugio, Kenji Inagaki

    Biochemical and biophysical research communications   417 ( 3 )   951 - 5   2012年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2011.12.033

    Web of Science

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  • Synthesis of unnatural alkaloid scaffolds by exploiting plant polyketide synthase. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Makoto Yamashita, She-Po Shi, Toshiyuki Wakimoto, Shin Kondo, Ryohei Kato, Shigetoshi Sugio, Toshiyuki Kohno, Ikuro Abe

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   108 ( 33 )   13504 - 9   2011年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1107782108

    Web of Science

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  • Functional expression of milligram quantities of the synthetic human serotonin transporter gene in a tetracycline-inducible HEK293 cell line. 国際誌

    Hidehito Takayama, Shigetoshi Sugio

    Protein expression and purification   76 ( 2 )   211 - 20   2011年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.pep.2010.11.015

    Web of Science

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  • Crystallization and preliminary X-ray analysis of 4-coumarate:CoA ligase from Arabidopsis thaliana. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Takahiro Mori, Kiyofumi Wanibuchi, Ryohei Kato, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   67 ( Pt 3 )   409 - 11   2011年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309111002181

    Web of Science

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  • Structural basis for the one-pot formation of the diarylheptanoid scaffold by curcuminoid synthase from Oryza sativa. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Kiyofumi Wanibuchi, Hirohiko Nii, Ryohei Kato, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   107 ( 46 )   19778 - 83   2010年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1011499107

    Web of Science

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  • Expression, purification and crystallization of a plant type III polyketide synthase that produces diarylheptanoids. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Kiyofumi Wanibuchi, Ryohei Kato, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   66 ( Pt 8 )   948 - 50   2010年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309110023572

    Web of Science

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  • A structure-based mechanism for benzalacetone synthase from Rheum palmatum. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Yoshihiko Shimokawa, Michikazu Tanio, Ryohei Kato, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Toshiyuki Kohno, Ikuro Abe

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   107 ( 2 )   669 - 73   2010年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.0909982107

    Web of Science

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  • Overexpression, Purification and Functional Characterization of the Human Serotonin Transporter

    Hidehito Takayama, Shigetoshi Sugio

    BIOPHYSICAL JOURNAL   98 ( 3 )   505A - 505A   2010年1月

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  • Structural characterization of L-glutamate oxidase from Streptomyces sp. X-119-6. 国際誌

    Jiro Arima, Chiduko Sasaki, Chika Sakaguchi, Hiroshi Mizuno, Takashi Tamura, Akiko Kashima, Hitoshi Kusakabe, Shigetoshi Sugio, Kenji Inagaki

    The FEBS journal   276 ( 14 )   3894 - 903   2009年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1742-4658.2009.07103.x

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  • 21 ベンザルアセトンの骨格を構築する植物ポリケタイド合成酵素の構造と機能(口頭発表の部)

    森田 洋行, 鰐渕 清史, 安部 剛史, 野口 博司, 杉尾 成俊, 河野 俊之, 阿部 郁朗

    天然有機化合物討論会講演要旨集   50th ( 50 )   149 - 154   2008年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:天然有機化合物討論会  

    Benzalacetone synthase (BAS) is a plant-specific chalcone synthase (CHS) superfamily type III poyketide synthase (PKS) that catalyzes a one-step decarboxylative condensation of 4-coumaroyl-CoA with malonyl-CoA. The diketide forming activity of Rheum palmatum BAS is attributed to the characteristic substitution of the conserved active-site Phe215 with Leu (numbering in Medicago sativa CHS). To further understand the intimate three-dimensional structural details of the enzyme catalyzed processes, we carried out X-ray crystallographic analyses of R. palmatum BAS. The crystal structures solved at 1.6Å and 1.8Å resolution suggested that, unlike M. sativa CHS, R. palmatum BAS utilizes an alternative active-site pocket to lock the aromatic moiety of the coumaroyl starter for the diketide formation reaction. These results provided structural insights into the functional diversity of type III PKS superfamily enzymes, and suggest strategies for the engineered biosynthesis of plant polyketides.

    DOI: 10.24496/tennenyuki.50.0_149

    CiNii Books

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  • Trimeric structure and conformational equilibrium of M-ficolin fibrinogen-like domain. 国際誌

    Michikazu Tanio, Shin Kondo, Shigetoshi Sugio, Toshiyuki Kohno

    Journal of synchrotron radiation   15 ( Pt 3 )   243 - 5   2008年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S0909049507054325

    Web of Science

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  • Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a plant type III polyketide synthase that produces benzalacetone. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Michikazu Tanio, Shin Kondo, Ryohei Kato, Kiyofumi Wanibuchi, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe, Toshiyuki Kohno

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   64 ( Pt 4 )   304 - 6   2008年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309108006775

    Web of Science

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  • Ascaris suum cytochrome b5, an adult-specific secretory protein reducing oxygen-avid ferric hemoglobin. 国際誌

    Muneaki Hashimoto, Shinzaburo Takamiya, Takehiro Yokota, Yoshitaka Nakajima, Fumiyuki Yamakura, Shigetoshi Sugio, Takashi Aoki

    Archives of biochemistry and biophysics   471 ( 1 )   42 - 9   2008年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.abb.2007.12.003

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  • Crystallization and preliminary crystallographic analysis of an octaketide-producing plant type III polyketide synthase. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Shin Kondo, Ryohei Kato, Kiyofumi Wanibuchi, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe, Toshiyuki Kohno

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63 ( Pt 11 )   947 - 9   2007年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309107047069

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  • 3 植物由来新規III型ポリケタイド合成酵素の結晶構造の解明と機能改変(口頭発表の部)

    森田 洋行, 鰐渕 清史, 近藤 伸, 小黒 聡史, 野間 久史, 野口 博司, 杉尾 成俊, 河野 俊之, 阿部 郁朗

    天然有機化合物討論会講演要旨集   49th ( 49 )   13 - 18   2007年8月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(研究会,シンポジウム資料等)   出版者・発行元:天然有機化合物討論会  

    Pentaketide chromone synthase (PCS) from Aloe arborescens is a novel plant-specific type III polyketide synthase (PKS) that produces 5,7-dihydroxy-2-methylchromone from five molecules of malonyl-CoA. On the basis of the crystal structures of wild-type and M207G mutant PCS, F80A/Y82A/M207G triple mutant was constructed and shown to produce an unnatural novel nonaketide naphthopyrone by sequential condensations of nine molecules of malonyl-CoAs. This is the first demonstration of the formation of a nonaketide by the structurally simple type III PKS. A homology model predicted that the active-site cavity volume of the triple mutant is increased to four times of that of the wild-type PCS.

    DOI: 10.24496/tennenyuki.49.0_13

    CiNii Books

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  • Structure of the biotin carboxylase domain of pyruvate carboxylase from Bacillus thermodenitrificans. 国際誌

    Shin Kondo, Yoshitaka Nakajima, Shigetoshi Sugio, Shinji Sueda, Md Nurul Islam, Hiroki Kondo

    Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   63 ( Pt 8 )   885 - 90   2007年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S0907444907029423

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  • Expression, purification and crystallization of a human tau-tubulin kinase 2 that phosphorylates tau protein. 国際誌

    Michiko Kitano-Takahashi, Hiroyuki Morita, Shin Kondo, Kayoko Tomizawa, Ryohei Kato, Michikazu Tanio, Yoshiko Shirota, Hiroshi Takahashi, Shigetoshi Sugio, Toshiyuki Kohno

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63 ( Pt 7 )   602 - 4   2007年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309107028783

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  • Crystallization and preliminary crystallographic analysis of an acridone-producing novel multifunctional type III polyketide synthase from Huperzia serrata. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Shin Kondo, Ryohei Kato, Kiyofumi Wanibuchi, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe, Toshiyuki Kohno

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63 ( Pt 7 )   576 - 8   2007年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309107026164

    Web of Science

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  • Structural insight into chain-length control and product specificity of pentaketide chromone synthase from Aloe arborescens. 国際誌

    Hiroyuki Morita, Shin Kondo, Satoshi Oguro, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe, Toshiyuki Kohno

    Chemistry & biology   14 ( 4 )   359 - 69   2007年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.chembiol.2007.02.003

    Web of Science

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  • Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the receptor-uncoupled mutant of Galphai1. 国際誌

    Tomohito Morikawa, Ayumu Muroya, Yoshitaka Nakajima, Takeshi Tanaka, Keiko Hirai, Shigetoshi Sugio, Kaori Wakamatsu, Toshiyuki Kohno

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63 ( Pt 2 )   139 - 41   2007年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309107003363

    Web of Science

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  • Trivalent recognition unit of innate immunity system - Crystal structure of trimeric human M-ficolin fibrinogen-like domain

    Michikazu Tanio, Shin Kondo, Shigetoshi Sugio, Toshiyuki Kohno

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   282 ( 6 )   3889 - 3895   2007年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1074/jbc.M608627200

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  • Crystal structure of human dual specificity phosphatase, JNK stimulatory phosphatase-1, at 1.5 angstrom resolution

    Takehiro Yokota, Yukinori Nara, Akiko Kashima, Keiko Matsubara, Satoru Misawa, Ryohei Kato, Shigetoshi Sugio

    PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS   66 ( 2 )   272 - 278   2007年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/prot.21152

    Web of Science

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  • Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a novel plant type III polyketide synthase that produces pentaketide chromone

    Hiroyuki Morita, Shin Kondo, Tsuyoshi Abe, Hiroshi Noguchi, Shigetoshi Sugio, Ikuro Abe, Toshiyuki Kohno

    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS   62   899 - 901   2006年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S174430910602968X

    Web of Science

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  • The crystal structure of hypothetical methyltransferase from Thermus thermophilus HB8

    Chizuko Sasaki, Ikuko Sugiura, Akio Ebihara, Takashi Tamura, Shigetoshi Sugio, Kenji Nagaki

    PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS   64 ( 2 )   552 - 557   2006年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/prot.21011

    Web of Science

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  • P-170 CRYSTAL STRUCTURE OF A NOVEL PLANT TYPE III POLYKETIDE SYNTHASE THAT PRODUCES PENTAKETIDE CHROMONE

    Morita Hiroyuki, Kondo Shin, Oguro Satoshi, Noguchi Hiroshi, Sugio Shigetoshi, Abe Ikuro, Kohno Toshiyuki

    International Symposium on the Chemistry of Natural Products   2006   "P - 170"   2006年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:天然有機化合物討論会  

    DOI: 10.24496/intnaturalprod.2006.0__P-170_

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  • Overexpression, purification and preliminary crystallographic analysis of human M-ficolin fibrinogen-like domain

    Michikazu Tanio, Shin Kondo, Shigetoshi Sugio, Toshiyuki Kohno

    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS   62   652 - 655   2006年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1744309106019786

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  • Unique structure of Ascaris suum b5-type cytochrome: an additional α-helix and positively charged residues on the surface domain interact with redox partners

    Yokota T, Nakajima Y, Yamakura F, Sugio S, Hashimoto M, Takamiya S

    Biochemical Journal   394 ( 2 )   437 - 447   2006年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1042/BJ20051308

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  • 2P037 X-ray crystallographic analysis of the receptor uncoupling mutant of Gαi1(29. Protein structure and dynamics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

    Morikawa Tomohito, Muroya Ayumu, Tanaka Takeshi, Sugio Shigetoshi, Wakamatsu Kaori, Kohno Toshiyuki

    生物物理   46 ( 2 )   S305   2006年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.46.S305_1

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  • 2P047 ヒトM-フィコリンフィブリノーゲン様ドメインの三量体構造(蛋白質 B) 構造・機能相関))

    谷生 道一, 近藤 伸, 杉尾 成俊, 河野 俊之

    生物物理   45   S131   2005年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.45.S131_3

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  • Structure of human translin at 2.2 A resolution. 査読 国際誌

    Ikuko Sugiura, Chiduko Sasaki, Tsukasa Hasegawa, Toshiyuki Kohno, Shigetoshi Sugio, Hideaki Moriyama, Masataka Kasai, Takao Matsuzaki

    Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   60 ( Pt 4 )   674 - 9   2004年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The structure of human translin at 2.2 A resolution is reported in space group C222(1). Translin forms a tetramer in the asymmetric unit. Although the monomer structure is almost the same as the crystal structure of murine translin in space group P2(1)2(1)2, the relative positions of the tetramers differ between the human and murine translins. This suggests that the multimerization of translin is flexible; the flexibility may be related to the binding to DNA/RNA.

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  • Structural insight into nucleotide recognition in tau-protein kinase I/glycogen synthase kinase 3 beta. 査読 国際誌

    Masaaki Aoki, Takehiro Yokota, Ikuko Sugiura, Chizuko Sasaki, Tsukasa Hasegawa, Chieko Okumura, Koichi Ishiguro, Toshiyuki Kohno, Shigetoshi Sugio, Takao Matsuzaki

    Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   60 ( Pt 3 )   439 - 46   2004年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Human tau-protein kinase I (TPK I; also known as glycogen synthase kinase 3 beta; GSK3 beta) is a serine/threonine protein kinase that participates in Alzheimer's disease. Here, binary complex structures of full-length TPK I/GSK3 beta with the ATP analogues ADP and AMPPNP solved by the X-ray diffraction method at 2.1 and 1.8 A resolution, respectively, are reported. TPK I/GSK3 beta is composed of three domains: an N-terminal domain consisting of a closed beta-barrel structure, a C-terminal domain containing a 'kinase fold' structure and a small extra-domain subsequent to the C-terminal domain. The catalytic site is between the two major domains and has an ATP-analogue molecule in its ATP-binding site. The adenine ring is buried in the hydrophobic pocket and interacts specifically with the main-chain atoms of the hinge loop. The overall structure and substrate-binding residues are similar to those observed in other Ser/Thr protein kinases, while Arg141 (which is not conserved among other Ser/Thr protein kinases) is one of the key residues for specific ATP/ADP recognition by TPK I/GSK3 beta. No residues are phosphorylated, while the orientation of the activation loop in TPK I/GSK3 beta is similar to that in phosphorylated CDK2 and ERK2, suggesting that TPK I/GSK3 beta falls into a conformation that enables it to be constitutively active.

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  • Structure of the biotin carboxylase subunit of pyruvate carboxylase from Aquifex aeolicus at 2.2 Å resolution

    Shin Kondo, Yoshitaka Nakajima, Shigetoshi Sugio, Yong-Biao Jin, Shinji Sueda, Hiroki Kondo

    Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography   60 ( 3 )   486 - 492   2004年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S0907444904000423

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  • Expression, purification and crystallization of human tau-protein kinase I/glycogen synthase kinase-3 beta 査読

    M Aoki, M Iwamoto-Sugai, Sugiura, I, C Sasaki, T Hasegawa, C Okumura, S Sugio, T Kohno, T Matsuzaki

    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY   56   1464 - 1465   2000年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Expression, purification and crystallization of human tau-protein kinase I/glycogen synthase kinase-3beta. 国際誌

    M Aoki, M Iwamoto-Sugai, I Sugiura, C Sasaki, T Hasegawa, C Okumura, S Sugio, T Kohno, T Matsuzaki

    Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   56 ( Pt 11 )   1464 - 5   2000年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Human tau-protein kinase I (TPK-I; also known as glycogen synthase kinase-3beta, GSK-3beta) is a serine/threonine protein kinase. Full-length TPK-I/GSK-3beta was expressed in Escherichia coli as a fusion protein with a 6xHis tag at the C-terminus and was crystallized using the hanging-drop vapour-diffusion method. Prismatic crystals of dimensions 0.4 x 0.2 x 0.1 mm were obtained using 12-15%(w/v) polyethylene glycol 6000 as a precipitant at 278 K. The crystals belong to the orthorhombic space group P2(1)2(1)2(1), with unit-cell parameters a = 82.9, b = 86.1, c = 178.1 A measured at 100 K, diffract to 2.3 A resolution and seem to contain two enzyme molecules per asymmetric unit.

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MISC

  • 放線菌由来フラビン酵素L-グルタミン酸酸化酵素のユニークな構造(研究論文紹介)

    有馬 二朗, Sasaki Chiduko, Sakaguchi Chika, Mizuno Hiroshi, Tamura Takashi, Kashima Akiko, Kusakabe Hitoshi, Sugio Shigetoshi, 稲垣 賢二

    ビタミン   85 ( 1 )   23 - 24   2011年1月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   出版者・発行元:日本ビタミン学会  

    DOI: 10.20632/vso.85.1_23

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  • 結晶構造に基づく植物ポリケタイド合成酵素の反応機構の解明

    森田洋行, 下川良彦, 加藤良平, 杉尾成俊, 河野俊之, 阿部郁朗

    日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集   10th   2010年

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  • ダイオウ由来ベンザルアセトン合成酵素の結晶構造解析と反応機構

    森田洋行, 森田洋行, 野口博司, 杉尾成俊, 河野俊之, 阿部郁朗, 阿部郁朗

    天然薬物の開発と応用シンポジウム講演要旨集   17th   2008年

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  • ダイオウ由来ベンザルアセトン合成酵素の結晶構造解析

    森田洋行, 森田洋行, 野口博司, 杉尾成俊, 河野俊之, 阿部郁朗, 阿部郁朗

    日本生薬学会年会講演要旨集   55th   2008年

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  • M-フィコリン異物認識ドメインの三量体構造

    谷生道一, 近藤伸, 杉尾成俊, 河野俊之

    日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集   7th   2007年

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  • ベンタケタイドクロモン合成酵素のX線結晶構造解析

    森田洋行, 近藤伸, 小黒聡史, 野口博司, 杉尾成俊, 阿部郁朗, 阿部郁朗, 河野俊之

    日本薬学会年会要旨集   126th ( 4 )   2006年

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  • Pronounced conversion of the metal-specific activity of superoxide dismutase from Porphyromonas gingivalis by the mutation of a single amino acid (Gly155Thr) located apart from the active site

    F Yamakura, S Sugio, BY Hiraoka, D Ohmori, T Yokota

    BIOCHEMISTRY   42 ( 36 )   10790 - 10799   2003年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi0349625

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  • Crystal structure of cambialistic superoxide dismutase from Porphyromonas gingivalis

    S Sugio, BY Hiraoka, F Yamakura

    EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY   267 ( 12 )   3487 - 3495   2000年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

    DOI: 10.1046/j.1432-1327.2000.01373.x

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 二次代謝酵素の機能制御と物質生産

    研究課題/領域番号:23241068  2011年4月 - 2015年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    阿部 郁朗, 脇本 敏幸, 淡川 孝義, 松田 侑大, 森田 洋行, 杉尾 成俊, 野口 博司, 久城 哲夫

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    配分額:49400000円 ( 直接経費:38000000円 、 間接経費:11400000円 )

    ポリケタイド合成酵素やクマロイルCoAリガーゼなど、天然物の生合成に関わる二次代謝酵素の中には、極めて寛容な基質特異性と潜在的触媒能力を有するものがあり、人為的な機能制御と分子多様性創出の格好のモデルとなりうる。本研究では、X線結晶構造解析を基盤として、タンパク工学の手法を駆使することにより、さらなる酵素触媒機能の拡張に成功した。また、人工基質を作用させることなどにより、一連の新規超天然型天然物を創出した。加えて、カリクリン、テレオシジン、アンチマイシンなど、一連の複雑骨格生物活性二次代謝産物の生合成遺伝子クラスターのクローニングと生合成マシナリーの詳細の解明に成功した。

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