2026/04/28 更新

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クニシゲ　リナ
國重　莉奈
KUNISHIGE RINA
所属
総合研究院 細胞制御工学研究センター 助教
職名
助教
外部リンク

学位

  • 博士（学術） （ 2021年3月 ）

研究キーワード

  • iPS細胞

  • 神経分化

  • セミインタクト細胞

  • Targeted protein degradation

  • 画像解析

  • リシール法

  • 共焦点顕微鏡

  • 蛍光イメージング

  • ネットワーク解析

  • バイオイメージング

研究分野

  • ライフサイエンス / 細胞生物学

学歴

  • 東京大学   大学院総合文化研究科 広域科学専攻   生命環境科学系 博士課程

    2017年4月 - 2021年3月

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  • 東京大学   大学院総合文化研究科 広域科学専攻   生命環境科学系 修士課程

    2015年4月 - 2017年3月

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  • 東京大学   教養学部   統合自然科学科

    2011年4月 - 2015年3月

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経歴

  • 東京科学大学   総合研究院   助教

    2025年4月 - 現在

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    国名：日本国

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  • 東京科学大学   総合研究院   特任助教

    2024年10月 - 2025年3月

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  • 東京工業大学   科学技術創成研究院   特任助教

    2021年4月 - 2024年9月

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  • 東京大学   大学院総合文化研究科 広域科学専攻生命環境科学系   リサーチ・アシスタント

    2020年4月 - 2021年3月

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  • 東京大学   大学院総合文化研究科 広域科学専攻生命環境科学系   ティーチング・アシスタント

    2016年 - 2019年

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  • 東京大学   博士課程教育リーディングプログラム 「多文化共生・統合人間学プログラム」（IHS）   プログラム生

    2015年4月 - 2021年3月

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所属学協会

  • 日本分子生物学会

    2023年9月 - 現在

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  • ⽇本ケミカルバイオロジー学会

    2023年 - 現在

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  • 日本毒性学会

    2023年 - 現在

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  • 日本薬理学会

    2022年 - 現在

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  • 日本細胞生物学会

    2022年 - 現在

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  • 日本生化学会

    2022年 - 現在

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論文

  • Unveiling and stratifying cell cycle-dependent drug efficacy using a single-cell PLOM-CON approach with correlation anomaly and presage protein signals

    Yoshiyuki Noguchi, Rina Kunishige, Naeko Shinozaki-Narikawa, Hiroshi Yamashita, Kazuyuki Aihara, Masayuki Murata, Fumi Kano

    Communications Biology   2025年10月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s42003-025-08916-w

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  • Protein covariation networks for elucidating ferroptosis inducer mechanisms and potential synergistic drug targets

    Rina Kunishige, Yoshiyuki Noguchi, Naomi Okamoto, Lei Li, Akito Ono, Masayuki Murata, Fumi Kano

    Communications Biology   2025年3月

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    担当区分：筆頭著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s42003-025-07886-3

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  • BMP4-SMAD1/5/9-RUNX2 pathway activation inhibits neurogenesis and oligodendrogenesis in Alzheimer's patients' iPSCs in senescence-related conditions. 国際誌

    Daiki Nakatsu, Rina Kunishige, Yuki Taguchi, Naeko Shinozaki-Narikawa, Kishiko Osaka, Kayo Yokomizo, Mami Ishida, Shunsuke Takei, Shoko Yamasaki, Keita Hagiya, Kotaro Hattori, Tadashi Tsukamoto, Masayuki Murata, Fumi Kano

    Stem cell reports   18 ( 5 )   1246 - 1246   2023年5月

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  • BMP4-SMAD1/5/9-RUNX2 pathway activation inhibits neurogenesis and oligodendrogenesis in Alzheimer's patients’ iPSCs in senescence-related conditions

    Daiki Nakatsu, Rina Kunishige, Yuki Taguchi, Naeko Shinozaki-Narikawa, Kishiko Osaka, Kayo Yokomizo, Mami Ishida, Shunsuke Takei, Shoko Yamasaki, Keita Hagiya, Kotaro Hattori, Tadashi Tsukamoto, Masayuki Murata, Fumi Kano

    Stem Cell Reports   18 ( 3 )   688 - 705   2023年3月

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    担当区分：筆頭著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.stemcr.2023.01.004

    Scopus

    PubMed

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  • Targeted protein degradation by Trim-Away using cell resealing coupled with microscopic image-based quantitative analysis. 国際誌

    Rina Kunishige, Masayuki Murata, Fumi Kano

    Frontiers in cell and developmental biology   10   1027043 - 1027043   2022年12月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    "Trim-Away" technology enables rapid degradation of endogenous proteins without prior modification of protein-coding genes or mRNAs through delivery of antibodies that target proteins of interest. Although this approach can be readily applied to almost any cytosolic protein, strategies for cytosolic antibody delivery have been limited to microinjection or electroporation, which require skill-dependent operation or specialized equipment. Thus, the development of antibody delivery methods that are convenient, scalable, and preferably do not require detachment of adherent cells is required to extend the versatility of the Trim-Away method. Here, we developed a cell resealing technique optimized for Trim-Away degradation, which uses the pore-forming toxin streptolysin O (SLO) to permeabilize the cell membrane and delivered the antibodies of interest into HEK293T, HeLa, and HK-2 cell lines. We demonstrated the ability of Trim-Away protein degradation using IKKα and mTOR as targets, and we showed the availability of the developed system in antibody screening for the Trim-Away method. Furthermore, we effectively coupled Trim-Away with cyclic immunofluorescence and microscopic image-based analysis, which enables single-cell multiplexed imaging analysis. Taking advantage of this new analysis strategy, we were able to compensate for low signal-to-noise due to cell-to-cell variation, which occurs in the Trim-Away method because of the heterogenous contents of the introduced antibody, target protein, and TRIM21 in individual cells. Therefore, the reported cell resealing technique coupled with microscopic image analysis enables Trim-Away users to elucidate target protein function and the effects of target protein degradation on various cellular functions in a more quantitative and precise manner.

    DOI： 10.3389/fcell.2022.1027043

    PubMed

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  • Microscopic image-based covariation network analysis for actin scaffold-modified insulin signaling

    Yoshiyuki Noguchi, Fumi Kano, Nobuhiko Maiya, Chisako Iwamoto, Shoko Yamasaki, Yosuke Otsubo, Daiki Nakatsu, Rina Kunishige, Masayuki Murata

    iScience   24 ( 7 )   102724 - 102724   2021年7月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier {BV}  

    DOI： 10.1016/j.isci.2021.102724

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  • Calcium phosphate microcrystals in the renal tubular fluid accelerate chronic kidney disease progression

    Kazuhiro Shiizaki, Asako Tsubouchi, Yutaka Miura, Kinya Seo, Takahiro Kuchimaru, Hirosaka Hayashi, Yoshitaka Iwazu, Marina Miura, Batpurev Battulga, Nobuhiko Ohno, Toru Hara, Rina Kunishige, Mamiko Masutani, Keita Negishi, Kazuomi Kario, Kazuhiko Kotani, Toshiyuki Yamada, Daisuke Nagata, Issei Komuro, Hiroshi Itoh, Hiroshi Kurosu, Masayuki Murata, Makoto Kuro-o

    The Journal of Clinical Investigation   2021年6月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：The American Society for Clinical Investigation  

    DOI： 10.1172/JCI145693

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  • Calciprotein particle-induced cytotoxicity via lysosomal dysfunction and altered cholesterol distribution in renal epithelial HK-2 cells

    Rina Kunishige, Mai Mizoguchi, Asako Tsubouchi, Kenjiro Hanaoka, Yutaka Miura, Hiroshi Kurosu, Yasuteru Urano, Makoto Kuro-o, Masayuki Murata

    Scientific Reports   10 ( 1 )   2020年12月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Springer Science and Business Media {LLC}  

    <jats:title>Abstract</jats:title><jats:p>Dietary phosphate overload induces chronic kidney disease (CKD), and calciprotein particles (CPPs), a form of nanoparticle comprising calcium phosphate and serum proteins, has been proposed to cause renal toxicity. However, the mechanism of CPP cytotoxicity in renal tubular cells is unknown. Here we show that in renal proximal tubular epithelial HK-2 cells, endocytosed CPPs accumulate in late endosomes/lysosomes (LELs) and increase their luminal pH by ~ 1.0 unit. This results in a decrease in lysosomal hydrolase activity and autophagic flux blockage without lysosomal rupture and reactive oxygen species generation. CPP treatment led to vulnerability to H<jats:sub>2</jats:sub>O<jats:sub>2</jats:sub>-induced oxidative stress and plasma membrane injury, probably because of autophagic flux blockage and decreased plasma membrane cholesterol, respectively. CPP-induced disruption of lysosomal homeostasis, autophagy flux and plasma membrane integrity might trigger a vicious cycle, leading to progressive nephron loss.</jats:p>

    DOI： 10.1038/s41598-020-77308-3

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    その他リンク： http://www.nature.com/articles/s41598-020-77308-3

  • The cell resealing technique for manipulating, visualizing, and elucidating molecular functions in living cells

    Rina Kunishige, Fumi Kano, Masayuki Murata

    Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects   1864 ( 2 )   129329 - 129329   2020年2月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier {BV}  

    DOI： 10.1016/j.bbagen.2019.03.015

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  • Yip1A, a Novel Host Factor for the Activation of the IRE1 Pathway of the Unfolded Protein Response during Brucella Infection

    Yuki Taguchi, Koichi Imaoka, Michiyo Kataoka, Akihiko Uda, Daiki Nakatsu, Sakuya Horii-Okazaki, Rina Kunishige, Fumi Kano, Masayuki Murata

    PLOS Pathogens   11 ( 3 )   2015年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Public Library of Science ({PLoS})  

    DOI： 10.1371/journal.ppat.1004747

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書籍等出版物

  • 革新的AI創薬 : 医療ビッグデータ、人工知能がもたらす創薬研究の未来像

    小長谷, 明彦（ 担当： 分担執筆 範囲: 第6節 共変動ネットワーク解析法とリシール細胞技術を基盤とするAI主導の創薬・細胞医薬支援プラットフォーム創成）

    エヌ・ティー・エス  2022年7月  （ ISBN:9784860437886 ）

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    総ページ数：2, 7, 350, 8p, 図版15p   記述言語：日本語  

    CiNii Books

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MISC

  • 蛋白質の細胞内局在情報を活用したシグナル伝達系分析手法の開発

    米谷 信彦, 野口 誉之, 加納 ふみ, 岩本 智沙子, 山﨑 聖子, 大坪 洋介, 中津 大貴, 國重 莉奈, 村田 昌之

    第49回日本毒性学会学術年会 要旨集   2022年7月

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    掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（全国大会，その他学術会議）  

    DOI： 10.14869/toxpt.49.1.0_O-39

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  • セミインタクト細胞リシール技術を用いた新しい細胞編集・細胞デザイン

    加納 ふみ, 國重 莉奈

    細胞   54 ( 4 )   186 - 189   2022年4月

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    記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：(株)ニュー・サイエンス社  

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  • セミインタクト細胞リシール技術を用いた細胞機能解析

    國重 莉奈, 加納 ふみ, 村田 昌之

    生体の科学   69 ( 3 )   247 - 251   2018年6月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

    DOI： 10.11477/mf.2425200804

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講演・口頭発表等

  • 細胞状態の変化を活写するネットワーク解析法を用いた新規フェロトーシス誘導剤の作用機序解明

    國重 莉奈, 野口 誉之, 岡本 直美, 李 蕾, 尾野 晃人, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第98回日本生化学会大会 

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    開催年月日： 2025年11月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：国立京都国際会館  

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  • Analyzing cellular senescence based on organelle structural and functional changes

    Noriko Yano, Akira Mitsuishi, Rina Kunishige, Masayuki Murata, Fumi Kano

    Joint Meeting of the 77th JSCB and 58th JSDB 

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    開催年月日： 2025年7月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：WINC AICHI  

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  • Elucidating ferroptosis inducer mechanisms and potential synergistic drug targets: application of PLOM-CON analysis

    Rina Kunishige, Yoshiyuki Noguchi, Naomi Okamoto, Lei Li, Akito Ono, Masayuki Murata, Fumi Kano

    Joint Meeting of the 77th JSCB and 58th JSDB 

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    開催年月日： 2025年7月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：WINC AICHI  

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  • 蛋白質の細胞内局在情報を活用したシグナル伝達系分析手法の開発と抗がん剤の作用機序研究への応用

    國重 莉奈, 野口 誉之, 田口 由起, 仲矢 丈雄, 相澤 健一, 米谷 信彦, 菅原 稔, 永井 良三, 村田 昌之, 加納 ふみ

    日本薬学会第145年会 

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    開催年月日： 2025年3月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：福岡国際会議場・マリンメッセ福岡  

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  • マルチプレックスIF法を用いたオルガネラ同士の量的調節機構の解明

    井上 慶彦, 成川 苗子, 國重 莉奈, 加納 ふみ

    日本分子生物学会 第47回 年会  2024年11月 

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    開催年月日： 2024年11月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：福岡国際会議場・マリンメッセ福岡  

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  • SMADタンパク質は白色脂肪細胞のベージュ化を調節する

    関根 涼太, 田口 由起, 中津 大貴, 國重 莉奈, 加納 ふみ

    日本分子生物学会 第47回 年会  2024年11月 

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    開催年月日： 2024年11月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：福岡国際会議場・マリンメッセ福岡  

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  • セミインタクト細胞リシール技術による「細胞編集」が可能とする細胞機能拡張 招待

    國重 莉奈, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第47回 日本分子生物学会年会  2024年11月  日本分子生物学会

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    開催年月日： 2024年11月

    会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

    開催地：福岡国際会議場、マリンメッセA館・B館   国名：日本国  

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  • 蛋白質の細胞内局在情報を活用したシグナル伝達経路分析手法の開発

    國重 莉奈, 野口 誉之, 田口 由起, 仲矢 丈雄, 相澤 健一, 米谷 信彦, 菅原 稔, 永井 良三, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第９７回日本生化学会大会 

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    開催年月日： 2024年11月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：パシフィコ横浜ノース  

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  • 細胞をデザインする

    國重 莉奈

    すずかけサイエンスデイ2024  2024年5月  東京工業大学

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    開催年月日： 2024年5月

    記述言語：日本語   会議種別：公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等  

    開催地：東京工業大学 すずかけ台キャンパス   国名：日本国  

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  • 細胞応答・細胞状態を表すタンパク質共変動ネットワーク: アクチンドメインの機能解析例

    國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第15回「光塾」  2024年1月 

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    開催年月日： 2024年1月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 細胞応答・細胞状態を表すタンパク質共変動ネットワーク

    國重 莉奈

    定量生物学の会 第十一回年会  2024年1月 

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    開催年月日： 2024年1月

    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

    開催地：東京大学 駒場IIキャンパス 生産技術研究所   国名：日本国  

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  • 細胞応答の層別解析を目指した蛋白質共変動ネットワーク解析法の開発

    國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第46回日本分子生物学会年会  2023年12月 

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    開催年月日： 2023年12月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

    開催地：神戸ポートアイランド（神戸国際会議場、神戸国際展示場、神戸ポートピアホテル）   国名：日本国  

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  • リシール細胞技術を用いた細胞内抗体導入によるTrim-Away標的タンパク質分解とマルチプレックス蛍光抗体法を組み合わせたタンパク質機能解析系の構築

    國重 莉奈, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第96回日本生化学会大会  2023年10月 

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    開催年月日： 2023年10月 - 2023年11月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 患者由来 iPS 細胞を用いたアルツハイマー依存的神経新生不全モデルの構築と構築モデル を用いた神経新生不全回復薬の同定

    中津 大貴, 國重 莉奈, 田口 由起, 成川-篠崎 苗子, 大坂 企志子, 横溝 佳代, 石田 真美, 武居 俊輔, 山﨑 聖子, 萩屋 啓太, 服部 功太郎, 塚本 忠, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第75回日本細胞生物学会大会  2023年6月 

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    開催年月日： 2023年6月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：奈良県コンベンションセンター  

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  • 薬剤に対する細胞応答を超早期に捉える新規タンパク質ネットワーク解析法

    國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第50回日本毒性学会学術年会  2023年6月 

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    開催年月日： 2023年6月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • リシール細胞技術によるTrim-Away標的タンパク質分解と解析系の構築

    國重 莉奈, 村田 昌之, 加納 ふみ

    ⽇本ケミカルバイオロジー学会 第17回年会  2023年5月 

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    開催年月日： 2023年5月

    会議種別：ポスター発表  

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  • インスリン刺激により一過性に形成されるアクチンドメインはグリコーゲン合成の開始場となる: 細胞状態を活写する新規ネットワーク解析法の応用例

    國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第95回日本生化学会大会  2022年11月 

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    開催年月日： 2022年11月

    会議種別：口頭発表（一般）  

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  • リシール細胞技術を用いた細胞内環境改変法と共変動ネットワークを用いたフェノタイプ解析 招待

    加納 ふみ, 國重 莉奈

    第95回日本生化学会大会  2022年11月 

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    開催年月日： 2022年11月

    開催地：名古屋国際会議場  

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  • 蛋白質の細胞内局在情報を活用したシグナル伝達系分析手法の開発

    米谷 信彦, 野口 誉之, 加納 ふみ, 岩本 智沙子, 山﨑 聖子, 大坪 洋介, 中津 大貴, 國重 莉奈, 村田 昌之

    第49回日本毒性学会学術年会  2022年7月 

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    開催年月日： 2022年6月 - 2022年7月

    会議種別：口頭発表（一般）  

    開催地：札幌コンベンションセンター  

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  • PLOM-CON 解析: 細胞形態およびタンパク質の修飾状態を考慮した細胞内状態の時系列変化の新規推定法

    野口 誉之, 國重 莉奈, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第74回日本細胞生物学会大会要旨集  2022年6月 

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    開催年月日： 2022年6月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：タワーホール船堀  

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  • インスリン刺激により一過性に形成される シグナリング「ハブ」としてのアクチンドメイン: PLOM-CON解析法を用いた新機能の予測と解明

    國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第74回日本細胞生物学会大会  2022年6月 

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    開催年月日： 2022年6月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：タワーホール船堀  

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  • 蛋白質の細胞内局在情報を活用したシグナル伝達経路分析手法の開発

    野口 誉之, 加納 ふみ, 米谷 信彦, 岩本 智沙子, 山﨑 聖子, 大坪 洋介, 中津 大貴, 國重 莉奈, 村田 昌之

    日本薬学会第142年会  2022年3月 

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    開催年月日： 2022年3月

    会議種別：ポスター発表  

    開催地：オンライン開催  

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  • オルガネラ形態変化の再構成と分子機序解明を可能にするリシール細胞技術と共変動ネットワーク解析法 招待

    加納ふみ, 國重莉奈

    第44回分子生物学会年会  2021年12月 

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    開催年月日： 2021年12月

    会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

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  • セミインタクト細胞リシール技術を用いた細胞機能解析・評価系の開発

    國重 莉奈, 園田 雄輝, 村上 真隆, 加納 ふみ, 村田 昌之

    日本ケミカルバイオロジー学会第１４回年会  2019年6月 

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    会議種別：ポスター発表  

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  • 「細胞状態」の時空間的変化を活写する共変動ネットワーク解析法による薬効評価

    國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第96回日本薬理学会年会  2022年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

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  • シグナル伝達系タンパク質の時空間ダイナミクスを捉える新規ネットワーク解析法の開発と薬効評価への応用

    國重 莉奈, 野口 誉之, 米谷 信彦, 中津 大貴, 村田 昌之, 加納 ふみ

    第147回日本薬理学会関東部会  2023年3月 

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    会議種別：ポスター発表  

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産業財産権

  • リシール細胞セット及びその製造方法

    加納ふみ, 村田昌之, 國重莉奈, 野口誉之

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    出願人：東京工業大学・東京大学

    出願番号：特願2022-165180  出願日：2022年10月

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  • 解析システム、解析装置、解析プログラム、及び解析方法

    村田 昌之, 加納 ふみ, 國重 莉奈, 野口 誉之

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    出願人：東京工業大学・東京大学

    出願番号：特願2022-111995  出願日：2022年7月

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受賞

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