2026/03/26 更新

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コンドウ ヨウヘイ
近藤 洋平
KONDO YOHEI
所属
生命理工学院 助教
職名
助教
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学位

  • 博士(工学) ( 2022年3月   東京大学 大学院 工学系研究科 )

  • 修士 ( 2019年3月   東京大学 大学院 工学系研究科 )

  • 学士 ( 2017年3月   東京大学 工学部 )

研究分野

  • ナノテク・材料 / ケミカルバイオロジー

  • ライフサイエンス / 生物有機化学

  • ナノテク・材料 / 生体化学

学歴

  • 東京大学   大学院工学系研究科   化学生命工学専攻 博士後期課程

    2019年4月 - 2022年3月

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  • 東京大学   大学院工学系研究科   化学生命工学専攻 博士前期課程

    2017年4月 - 2019年3月

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  • 東京大学   工学部   化学生命工学科

    2015年4月 - 2017年3月

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  • 東京大学   教養学部   理科Ⅰ類

    2013年4月 - 2015年3月

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経歴

  • 東京科学大学   生命理工学院   助教

    2024年10月 - 現在

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  • 東京工業大学   生命理工学院   助教

    2023年9月 - 2024年9月

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  • 株式会社三菱総合研究所   研究員

    2022年4月 - 2023年8月

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  • 日本学術振興会   特別研究員(DC1)

    2019年4月 - 2022年3月

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論文

  • Sensing the Concentration of Biological Reductants through Single-Molecule Fluorescence Blinking 査読

    Yohei Kondo, Shotaro Tsuchitori, Yuki Yonezawa, Tadao Takada, Atsushi Maruyama, Mamoru Fujitsuka, Kiyohiko Kawai

    The Journal of Physical Chemistry Letters   2025年5月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpclett.5c00475

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  • Directly monitoring the dynamic in vivo metabolisms of hyperpolarized 13 C-oligopeptides 査読 国際共著

    Yohei Kondo, Yutaro Saito, Tomohiro Seki, Yoichi Takakusagi, Norikazu Koyasu, Keita Saito, Jumpei Morimoto, Hiroshi Nonaka, Koichiro Miyanishi, Wataru Mizukami, Makoto Negoro, Abdelazim E. Elhelaly, Fuminori Hyodo, Masayuki Matsuo, Natarajan Raju, Rolf E. Swenson, Murali C. Krishna, Kazutoshi Yamamoto, Shinsuke Sando

    Science Advances   2024年10月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/sciadv.adp2533

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  • Design of Nuclear Magnetic Resonance Molecular Probes for Hyperpolarized Bioimaging

    Yohei Kondo, Hiroshi Nonaka, Yoichi Takakusagi, Shinsuke S, o

    Angewandte Chemie International Edition   60 ( 27 )   14779 - 14799   2021年6月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Wiley  

    DOI: 10.1002/anie.201915718

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  • Hidden Markov model analysis of fluorescence blinking in fluorescently labeled DNA

    Tatsuhiro Furuta, Shuya Fan, Tadao Takada, Yohei Kondo, Mamoru Fujitsuka, Atsushi Maruyama, Kiyohiko Kawai, Kazuma Nakamura

    Scientific Reports   2026年2月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    DOI: 10.1038/s41598-026-40876-x

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  • In vivo monitoring of hyperpolarized [15N]betaine-d11 signal for one hour 国際共著

    Ruki Ashikaga, Yutaro Saito, Abdelazim Elhelaly, Hiroyuki Yatabe, Yohei Kondo, Hiroshi Nonaka, Imai Hirohiko, Fuminori Hyodo, Masayuki Matsuo, Shinsuke Sando

    2025年4月

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    記述言語:英語  

    DOI: 10.26434/chemrxiv-2025-0qxks

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  • Structure-guided design enables development of a hyperpolarized molecular probe for the detection of aminopeptidase N activity in vivo

    Yohei Kondo

    Science Advances   8 ( 13 )   2022年4月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/SCIADV.ABJ2667

    Web of Science

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  • Structure-based relaxation analysis reveals C-terminal [1-13C]glycine-d2 in peptides has long spin-lattice relaxation time that is applicable to in vivo hyperpolarized magnetic resonance studies

    Yohei Kondo, Yutaro Saito, Tomohiro Seki, Yoichi Takakusagi, Jumpei Morimoto, Hiroshi Nonaka, Koichiro Miyanishi, Wataru Mizukami, Makoto Negoro, Abdelazim Elsayed Elhelaly, Fuminori Hyodo, Masayuki Matsuo, Natarajan Raju, Rolf Swenson, Murali C. Krishna, Kazutoshi Yamamoto, Shinsuke Sando

    2022年1月

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    出版者・発行元:American Chemical Society (ACS)  

    Dissolution-dynamic nuclear polarization (d-DNP) is a state-of-the-art technology that can dramatically enhance the detection sensitivity of nuclear magnetic resonance (NMR). DNP NMR has been applied to small molecules with stable isotopes and has been used to obtain metabolic and physiological information in vivo. However, the hyperpolarized state exponentially decays back to the thermal equilibrium state, depending on the spin-lattice relaxation time (T1). This signal decay has remained a major problem associated with this technology. Therefore, DNP NMR molecular probes useful for in vivo analysis have been limited to naturally occurring small molecules that inherently show long T1. While peptides are promising targets for DNP NMR studies, because of the limitation in T1, DNP NMR molecular probes applicable in vivo have been limited to amino acids or dipeptides. Herein we propose a 13C-labeling strategy to utilize the C-terminal [1-13C]Gly-d2 residue for realizing long T1 in peptides. Structure-based T1 relaxation analysis of amino acids and peptides revealed that (1) T1 does not decrease monotonically with increasing molecular weight and (2) T1 is not significantly affected by a side chain on the neighboring amino acid residue. These findings suggest that the C-terminal [1-13C]Gly-d2 residue affords sufficiently long T1 for biological uses, even in oligopeptides, and allowed us to develop 13C-b- casomorphin-5 (Tyr-Pro-Phe-Pro-[1-13C]Gly-d2, T1 = 24 ± 4 s at 3 T in H2O) and 13C-glutathione (g-Glu-Cys-[1-13C]Gly-d2, T1 = 58 ± 3 s at 3 T in H2O) as DNP NMR probes with long T1. We succeeded in in vivo detection of enzymatic conversions of these two probes. These results demonstrate the utility of our strategy and would contribute to further expansion of the substrate scope for DNP applications.

    DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-tfkk1

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  • Evaluation of enzymatic and magnetic properties of γ-glutamyl-[1-13C]glycine and its deuteration toward longer retention of the hyperpolarized state

    Yohei Kondo

    RSC Advances   11 ( 59 )   37011 - 37018   2021年

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/D1RA07343E

    Web of Science

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MISC

  • 超偏極MRI 分子プローブによる生体内オリゴペプチド代謝の直接検出

    近藤洋平, 山東信介

    バイオサイエンスとインダストリー トピックス   83 ( 5 )   2025年9月

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    担当区分:筆頭著者  

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  • 超高感度ペプチドプローブによる急性腎障害の可視化

    近藤洋平, 山東信介

    バイオサイエンスとインダストリー 目で見るバイオ   83 ( 5 )   2025年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語  

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  • グリシン誘導体型分子プローブを用いた生体内での超偏極MRIシグナルの長時間観測

    足利留樹, 齋藤雄太朗, 谷田部浩行, 近藤洋平, 野中洋, ELSAYED Elhelaly Abdelazim, 兵藤文紀, 松尾政之, 齋藤圭太, 高草木洋一, 高草木洋一, 山本和俊, KRISHNA Murali C., 山東信介

    日本化学会春季年会講演予稿集(Web)   105th   2025年

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  • 物質科学動的データに対する隠れマルコフシミュレーション:DNA分子の蛍光時系列データ解析

    古田達央, 中村和磨, 近藤洋平, 丸山厚, 川井清彦, 高田忠雄, 藤塚守

    日本物理学会講演概要集(CD-ROM)   79 ( 1 )   2024年

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  • 蛍光blinking制御による生体分子ダイナミクスの1分子計測

    川井清彦, 藤塚守, 丸山厚, 近藤洋平

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   47th   2024年

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  • 超偏極-核磁気共鳴法による生体内ペプチダーゼ活性の検出および可視化を指向した分子プローブの設計と開発

    谷田部 浩行, 近藤 洋平, 田村 伊織, 石田 諒, 関 智宏, 高草木 洋一, Elhelaly Abdelazim E., 大嶋 野歩, 兵藤 文紀, 松尾 政之, 山本 和俊, Krishna Murali C., 齋藤 雄太朗, 山東 信介

    JSMI Report   16 ( 2 )   89 - 89   2023年5月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本分子イメージング学会  

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  • 超偏極-核磁気共鳴法による生体内ペプチダーゼ活性の検出および可視化を指向した分子プローブの設計と開発

    谷田部 浩行, 近藤 洋平, 田村 伊織, 石田 諒, 関 智宏, 高草木 洋一, Elhelaly Abdelazim E., 大嶋 野歩, 兵藤 文紀, 松尾 政之, 山本 和俊, Krishna Murali C., 齋藤 雄太朗, 山東 信介

    JSMI Report   16 ( 2 )   89 - 89   2023年5月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本分子イメージング学会  

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  • 超偏極-核磁気共鳴法による生体内ペプチダーゼ活性の検出および可視化を指向した分子プローブの設計と開発

    谷田部 浩行, 近藤 洋平, 田村 伊織, 石田 諒, 関 智宏, 高草木 洋一, Elhelaly Abdelazim E., 大嶋 野歩, 兵藤 文紀, 松尾 政之, 山本 和俊, Krishna Murali C., 齋藤 雄太朗, 山東 信介

    JSMI Report   16 ( 2 )   89 - 89   2023年5月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本分子イメージング学会  

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  • 生体内分子送達技術とその応用-ドラッグデリバリーシステムとその周辺技術-高感度-核磁気共鳴技術を用いた生体内分子イメージング

    近藤洋平, 山東信介

    化学工学   83 ( 7 )   2019年

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    担当区分:筆頭著者  

    J-GLOBAL

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講演・口頭発表等

  • 超偏極生体分子イメージングのためのオリゴペプチド型MRI分子プローブの開発 招待

    第52回日本磁気共鳴医学会大会  2024年9月 

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    開催年月日: 2024年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • Development of oligopeptide DNP MRI molecular probes for in vivo studies 招待 国際会議

    Quantum Innovation 2024  2024年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • オリゴペプチド型超偏極核磁気共鳴分子プローブの開発研究 招待

    量子生命科学会第7回大会  2025年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 生体内代謝反応を可視化するオリゴペプチド型超偏極核磁気共鳴分子プローブの開発 招待

    一般社団法人バイオインダストリー協会"未来へのバイオ技術"勉強会  2025年6月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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受賞

  • 量子生命科学会令和7年度若手優秀賞

    2025年5月   量子生命科学会  

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞 

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  • 量子生命科学会第6回大会 Best Presentation Award

    2024年5月   量子生命科学会  

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞 

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  • 化学生命工学専攻長賞

    2022年3月   東京大学大学院 工学系研究科 化学生命工学専攻  

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  • 第 14 回日本分子イメージング学会学術集会 優秀発表賞

    2019年5月   日本分子イメージング学会  

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 網羅的1分子蛍光計測基盤が拓くアルコール代謝物によるDNA損傷分子メカニズムの理解

    2026年4月 - 2028年3月

    公益財団法人ロッテ財団  奨励研究助成【A】(個人研究助成) 

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    担当区分:研究代表者 

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  • 分子間衝突による蛍光明滅を利用したペプチド構造ダイナミクスの1分子微細計測

    研究課題/領域番号:25K18123  2025年4月 - 2027年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

    近藤 洋平

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    配分額:4810000円 ( 直接経費:3700000円 、 間接経費:1110000円 )

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  • 生体分子構造ダイナミクスの1分子時系列計測手法の開発補助事業

    2024年4月 - 2025年3月

    公益財団法人JKA  機械振興補助事業 若手研究 

    近藤 洋平

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    担当区分:研究代表者 

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  • 蛍光相関分光法を用いた複数金属イオン検出手法の開発

    2024年4月 - 2025年3月

    公益財団法人池谷科学技術振興財団  単年度研究 

    近藤 洋平

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    担当区分:研究代表者 

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  • 超高感度-核磁気共鳴分子プローブを用いた生体内レポーターアッセイ系の構築

    研究課題/領域番号:19J22848  2019年4月 - 2022年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

    近藤 洋平

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    配分額:2500000円 ( 直接経費:2500000円 )

    本研究課題では生物個体深部における目的遺伝子の発現解析を実現するレポーターアッセイ系の構築を目指して研究を遂行した。 生物個体におけるレポーターアッセイ系構築を実現する手法として、生体深部を非侵襲的に観測できる核磁気共鳴法(NMR)に着目した。NMRの原理的な検出感度の低さを動的核偏極法(DNP)と呼ばれるNMR高感度化技術によって克服することとした。しかしながら、多くの場合、DNPによって人工的に作られた高感度化シグナルは溶液状態において直ちに失われてしまうという実応用上の問題点がある。そこで本研究では、高感度化維持時間の大幅な改善を基質の分子構造レベルで試み、DNPを用いる高感度化レポーターアッセイ系構築の達成を目指した。特に、高感度化維持時間に大きな影響を与える分子構造とダイナミクスの理解を目指して研究を展開した。
    当該年度は、これまでに取得したペプチド型分子プローブの設計指針に基づいて開発したオリゴペプチド型超高感度NMR分子プローブの生体応用実験を進行させた。開発したオリゴペプチド型NMR分子プローブを用いて生体内で分子プローブが受ける代謝を観測することに成功した。この結果は、これまで生体内で用いることができないと考えられてきた分子量が大きなオリゴペプチドも適切な分子設計を施せば、生体応用可能な超高感度NMR分子プローブとして展開できることを実証するものであり、将来的には超高感度NMR分子プローブの分子構造の幅を大きく広げる可能性がある。

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担当経験のある科目(授業)

  • 生命理工学基礎実験・演習第二

    2023年9月 - 現在

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  • 生命理工学特別講義2

    2023年9月 - 現在

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