Organization
School of Life Science and Technology Assistant Professor
Title
Assistant Professor
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KONDO YOHEI
Degree
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博士（工学） ( 2022.3 東京大学 大学院 工学系研究科 )
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修士 ( 2019.3 東京大学 大学院 工学系研究科 )
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学士 ( 2017.3 東京大学 工学部 )
Research Areas
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Nanotechnology/Materials / Chemical biology
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Life Science / Bioorganic chemistry
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Nanotechnology/Materials / Bio chemistry
Education
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The University of Tokyo The Graduate School of Engineering Department of Chemistry and Biotechnology
2019.4 - 2022.3
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The University of Tokyo The Graduate School of Engineering Department of Chemistry and Biotechnology
2017.4 - 2019.3
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The University of Tokyo The Faculty of Engineering Department of Chemistry and Biotechnology
2015.4 - 2017.3
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The University of Tokyo College of Arts and Sciences
2013.4 - 2015.3
Research History
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Institute of Science Tokyo School of Life Science and Technology Assistant Professor
2024.10
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Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology Assistant Professor
2023.9 - 2024.9
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Mitsubishi Research Institute, Inc. Researcher
2022.4 - 2023.8
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日本学術振興会 特別研究員（DC1）
2019.4 - 2022.3
Papers
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Sensing the Concentration of Biological Reductants through Single-Molecule Fluorescence Blinking Reviewed
Yohei Kondo, Shotaro Tsuchitori, Yuki Yonezawa, Tadao Takada, Atsushi Maruyama, Mamoru Fujitsuka, Kiyohiko Kawai
The Journal of Physical Chemistry Letters 2025.5
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Directly monitoring the dynamic in vivo metabolisms of hyperpolarized 13 C-oligopeptides Reviewed International coauthorship
Yohei Kondo, Yutaro Saito, Tomohiro Seki, Yoichi Takakusagi, Norikazu Koyasu, Keita Saito, Jumpei Morimoto, Hiroshi Nonaka, Koichiro Miyanishi, Wataru Mizukami, Makoto Negoro, Abdelazim E. Elhelaly, Fuminori Hyodo, Masayuki Matsuo, Natarajan Raju, Rolf E. Swenson, Murali C. Krishna, Kazutoshi Yamamoto, Shinsuke Sando
Science Advances 2024.10
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Design of Nuclear Magnetic Resonance Molecular Probes for Hyperpolarized Bioimaging
Yohei Kondo, Hiroshi Nonaka, Yoichi Takakusagi, Shinsuke S, o
Angewandte Chemie International Edition 60 ( 27 ) 14779 - 14799 2021.6
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Hidden Markov model analysis of fluorescence blinking in fluorescently labeled DNA
Tatsuhiro Furuta, Shuya Fan, Tadao Takada, Yohei Kondo, Mamoru Fujitsuka, Atsushi Maruyama, Kiyohiko Kawai, Kazuma Nakamura
Scientific Reports 2026.2
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In vivo monitoring of hyperpolarized [15N]betaine-d11 signal for one hour International coauthorship
Ruki Ashikaga, Yutaro Saito, Abdelazim Elhelaly, Hiroyuki Yatabe, Yohei Kondo, Hiroshi Nonaka, Imai Hirohiko, Fuminori Hyodo, Masayuki Matsuo, Shinsuke Sando
2025.4
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Yohei Kondo
Science Advances 8 ( 13 ) 2022.4
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Yohei Kondo, Yutaro Saito, Tomohiro Seki, Yoichi Takakusagi, Jumpei Morimoto, Hiroshi Nonaka, Koichiro Miyanishi, Wataru Mizukami, Makoto Negoro, Abdelazim Elsayed Elhelaly, Fuminori Hyodo, Masayuki Matsuo, Natarajan Raju, Rolf Swenson, Murali C. Krishna, Kazutoshi Yamamoto, Shinsuke Sando
2022.1
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Yohei Kondo
RSC Advances 11 ( 59 ) 37011 - 37018 2021
MISC
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超偏極MRI 分子プローブによる生体内オリゴペプチド代謝の直接検出
近藤洋平, 山東信介
バイオサイエンスとインダストリー トピックス 83 ( 5 ) 2025.9
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超高感度ペプチドプローブによる急性腎障害の可視化
近藤洋平, 山東信介
バイオサイエンスとインダストリー 目で見るバイオ 83 ( 5 ) 2025.9
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In vivo long-term observation of the hyperpolarized MRI signal with a glycine-derived probe
足利留樹, 齋藤雄太朗, 谷田部浩行, 近藤洋平, 野中洋, ELSAYED Elhelaly Abdelazim, 兵藤文紀, 松尾政之, 齋藤圭太, 高草木洋一, 高草木洋一, 山本和俊, KRISHNA Murali C., 山東信介
日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 105th 2025
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Hidden Markov simulation for material science dynamic data: Analysis for fluorescence blinking data of DNA
古田達央, 中村和磨, 近藤洋平, 丸山厚, 川井清彦, 高田忠雄, 藤塚守
日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 79 ( 1 ) 2024
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蛍光blinking制御による生体分子ダイナミクスの1分子計測
川井清彦, 藤塚守, 丸山厚, 近藤洋平
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024
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超偏極-核磁気共鳴法による生体内ペプチダーゼ活性の検出および可視化を指向した分子プローブの設計と開発
谷田部 浩行, 近藤 洋平, 田村 伊織, 石田 諒, 関 智宏, 高草木 洋一, Elhelaly Abdelazim E., 大嶋 野歩, 兵藤 文紀, 松尾 政之, 山本 和俊, Krishna Murali C., 齋藤 雄太朗, 山東 信介
JSMI Report 16 ( 2 ) 89 - 89 2023.5
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超偏極-核磁気共鳴法による生体内ペプチダーゼ活性の検出および可視化を指向した分子プローブの設計と開発
谷田部 浩行, 近藤 洋平, 田村 伊織, 石田 諒, 関 智宏, 高草木 洋一, Elhelaly Abdelazim E., 大嶋 野歩, 兵藤 文紀, 松尾 政之, 山本 和俊, Krishna Murali C., 齋藤 雄太朗, 山東 信介
JSMI Report 16 ( 2 ) 89 - 89 2023.5
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超偏極-核磁気共鳴法による生体内ペプチダーゼ活性の検出および可視化を指向した分子プローブの設計と開発
谷田部 浩行, 近藤 洋平, 田村 伊織, 石田 諒, 関 智宏, 高草木 洋一, Elhelaly Abdelazim E., 大嶋 野歩, 兵藤 文紀, 松尾 政之, 山本 和俊, Krishna Murali C., 齋藤 雄太朗, 山東 信介
JSMI Report 16 ( 2 ) 89 - 89 2023.5
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生体内分子送達技術とその応用-ドラッグデリバリーシステムとその周辺技術-高感度-核磁気共鳴技術を用いた生体内分子イメージング
近藤洋平, 山東信介
化学工学 83 ( 7 ) 2019
Presentations
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超偏極生体分子イメージングのためのオリゴペプチド型MRI分子プローブの開発 Invited
第52回日本磁気共鳴医学会大会 2024.9
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Development of oligopeptide DNP MRI molecular probes for in vivo studies Invited International conference
Quantum Innovation 2024 2024.10
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オリゴペプチド型超偏極核磁気共鳴分子プローブの開発研究 Invited
量子生命科学会第7回大会 2025.5
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生体内代謝反応を可視化するオリゴペプチド型超偏極核磁気共鳴分子プローブの開発 Invited
一般社団法人バイオインダストリー協会"未来へのバイオ技術"勉強会 2025.6
Awards
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量子生命科学会令和7年度若手優秀賞
2025.5 量子生命科学会
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量子生命科学会第6回大会 Best Presentation Award
2024.5 量子生命科学会
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化学生命工学専攻長賞
2022.3 東京大学大学院 工学系研究科 化学生命工学専攻
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第 14 回日本分子イメージング学会学術集会 優秀発表賞
2019.5 日本分子イメージング学会
Research Projects
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網羅的1分子蛍光計測基盤が拓くアルコール代謝物によるDNA損傷分子メカニズムの理解
2026.4 - 2028.3
公益財団法人ロッテ財団 奨励研究助成【A】（個人研究助成）
Authorship：Principal investigator
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分子間衝突による蛍光明滅を利用したペプチド構造ダイナミクスの1分子微細計測
Grant number：25K18123 2025.4 - 2027.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
近藤 洋平
Grant amount：\4810000 （ Direct Cost: \3700000 、 Indirect Cost：\1110000 ）
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生体分子構造ダイナミクスの1分子時系列計測手法の開発補助事業
2024.4 - 2025.3
公益財団法人JKA 機械振興補助事業 若手研究
近藤 洋平
Authorship：Principal investigator
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蛍光相関分光法を用いた複数金属イオン検出手法の開発
2024.4 - 2025.3
公益財団法人池谷科学技術振興財団 単年度研究
近藤 洋平
Authorship：Principal investigator
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超高感度-核磁気共鳴分子プローブを用いた生体内レポーターアッセイ系の構築
Grant number：19J22848 2019.4 - 2022.3
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
近藤 洋平
Grant amount：\2500000 （ Direct Cost: \2500000 ）
本研究課題では生物個体深部における目的遺伝子の発現解析を実現するレポーターアッセイ系の構築を目指して研究を遂行した。 生物個体におけるレポーターアッセイ系構築を実現する手法として、生体深部を非侵襲的に観測できる核磁気共鳴法(NMR)に着目した。NMRの原理的な検出感度の低さを動的核偏極法(DNP)と呼ばれるNMR高感度化技術によって克服することとした。しかしながら、多くの場合、DNPによって人工的に作られた高感度化シグナルは溶液状態において直ちに失われてしまうという実応用上の問題点がある。そこで本研究では、高感度化維持時間の大幅な改善を基質の分子構造レベルで試み、DNPを用いる高感度化レポーターアッセイ系構築の達成を目指した。特に、高感度化維持時間に大きな影響を与える分子構造とダイナミクスの理解を目指して研究を展開した。
当該年度は、これまでに取得したペプチド型分子プローブの設計指針に基づいて開発したオリゴペプチド型超高感度NMR分子プローブの生体応用実験を進行させた。開発したオリゴペプチド型NMR分子プローブを用いて生体内で分子プローブが受ける代謝を観測することに成功した。この結果は、これまで生体内で用いることができないと考えられてきた分子量が大きなオリゴペプチドも適切な分子設計を施せば、生体応用可能な超高感度NMR分子プローブとして展開できることを実証するものであり、将来的には超高感度NMR分子プローブの分子構造の幅を大きく広げる可能性がある。
Teaching Experience
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生命理工学基礎実験・演習第二
2023.9
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生命理工学特別講義2
2023.9