2026/04/29 更新

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オカモト アキヒロ
岡本 章玄
OKAMOTO AKIHIRO
所属
総合研究院 自律システム材料学研究センター 特定教授
職名
特定教授
外部リンク

学位

  • 博士(工学) ( 東京大学大学院工学系研究科 )

研究分野

  • ナノテク・材料 / ナノバイオサイエンス

論文

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書籍等出版物

  • Extracellular Electron Uptake Mechanisms in Sulfate-Reducing Bacteria

    岡本 章玄, Xiao Deng

    2020年  ( ISBN:9789811547621

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    記述言語:英語  

    Sulfate-reducing bacteria (SRB) are ubiquitous in anaerobic environments, particularly in marine sediments, and play crucial roles in the biogeochemical cycling of carbon, sulfur, and metals, the biosynthesis of minerals, and anaerobic metal corrosion. While SRB are generally considered to utilize diffusive organics and gases (e.g., hydrogen) as the electron donors, recent studies revealed that some SRB can use extracellular insoluble solids (e.g., electrodes and partner microbial cells in a consortium) as electron donors for energy acquisition. However, the mechanism had been ambiguous for a decade, due to the difficulty to distinguish electron uptake reaction and hydrogen evolution on the surface of solids. This chapter summarizes research backgrounds and electrochemical methods and shows example studies regarding the extracellular electron uptake mechanisms and thermodynamics in SRB. These aspects have critical implications in SRB physiology, biogeological and biophysical processes, and anaerobic iron corrosion.

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  • ELECTROCHEMICAL TECHNIQUES AND APPLICATION TO CHARACTERIZE SINGLE- AND MULTICELLULAR ELECTRIC MICROBIAL FUNCTIONS

    ムルガン ムラリダハラン, グイヨネ アレクシ, 齋藤 淳貴, ミラン ワヒード, 鄧 驍, 岡本 章玄

    2019年 

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    記述言語:英語  

    ELECTROCHEMICAL TECHNIQUES AND APPLICATION TO CHARACTERIZE SINGLE- AND MULTI-CELLULAR ELECTRIC MICROBIAL FUNCTIONS

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  • Electrochemical Techniques and Applications to Characterize Single- and Multicellular Electric Microbial Functions

    齋藤 淳貴, ムルガン ムラリダハラン, 鄧 驍, グイヨネ アレクシ, ミラン ワヒード, 岡本 章玄

    2019年  ( ISBN:9781119611103

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    記述言語:英語  

    An introduction to the fundamental concepts and rules in bioelectrochemistry and explores latest advancements in the field

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MISC

  • 健全性崩壊をもたらす微生物による視認不可腐食の分子生物・電気化学的診断及び抑制技術の開発(委託研究); 令和3年度英知を結集した原子力科学技術・人材育成推進事業 査読

    岡本章玄, 若井暁, 平野伸一, 上野文義

    2023年1月

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    記述言語:日本語   掲載種別:機関テクニカルレポート,技術報告書,プレプリント等  

    DOI: 10.11484/jaea-review-2022-045

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  • Pathogens electrogenicity as a tool for in-situ metabolic activity monitoring and drug assessment in biofilms

    Waheed Miran, Divya Naradasu, Akihiro Okamoto

    iScience   24 ( 2 )   2021年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:書評論文,書評,文献紹介等   出版者・発行元:Elsevier Inc.  

    DOI: 10.1016/j.isci.2021.102068

    Scopus

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  • 電気細菌学者は電気羊の夢を見るか?

    岡本 章玄

    日本微生物生態学会誌   14 - 16   2020年

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    記述言語:日本語  

    電気細菌学者は電気羊の夢を見るか?

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  • 鉄還元細菌Shewanellaへのバクテリオファージ感染が細胞外電子伝達に及ぼす影響

    石原令梧, 岡本章玄, 岡部聡, 北島正章

    日本水環境学会年会講演集   54th   2020年

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  • ブラック電気細菌はなぜ・どうやって電子を流すのか?電子移動を自在に操る鉄腐食細菌、病原細菌

    岡本 章玄

    Chemistry   66 - 67   2020年

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    記述言語:日本語  

    ブラック電気細菌はなぜ・どうやって電子を流すのか?電子移動を自在に操る鉄腐食細菌、病原細菌

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  • ブラック電気細菌たちが来た

    岡本 章玄

    SEIBUTSU-KOGAKU KAISHI   549 - 549   2020年

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    記述言語:日本語  

    ブラック電気細菌たちが来た

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  • 微生物燃料電池によるエネルギーと物質生産の同時実現へ向けて

    岡本 章玄

    月刊バイオインダストリー   ( 7 )   75 - 83   2018年

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    記述言語:日本語  

    発電細菌を用いた微生物燃料電池技術は、創電型廃水処理技術や暗所での環境中電源として近年盛んに開発が進んでいる。しかし、細菌から電極への電子移動機構の包括的な理解へ向けた研究はまだ始まったばかりである。本稿では、該当分野における最新の基礎研究に基づき、発電と共役して進行することが明らかになった発酵反応、ならびにそれを利用した創電型物質生産技術について概説する。

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  • 金属腐食抑制への応用に向けた鉄還元細菌Shewanellaの溶菌性バクテリオファージの単離と特性解析

    石原令梧, 岡本章玄, 高木達馬, 岡部聡, 北島正章

    日本水環境学会年会講演集   52nd   2018年

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講演・口頭発表等

  • 細胞外電子移動と上流代謝反応の測度論的競争によって決まる微生物電極触媒活性

    OKAMOTO, Akihiro, HASHIMOTO, Kazuhito, Saito Junki

    Pacific Rim meeting on electrochemical and solid-state science  2016年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 外膜シトクロム反応中心の分子デザインによる細胞外電子移動の制御

    OKAMOTO, Akihiro, Tokunou Yoshihide, HASHIMOTO, Kazuhito

    Pacific Rim meeting on electrochemical and solid-state science  2016年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 生物外膜シトクロムを介する電子伝達反応に共役したプロトン移動機構の解明

    岡本 章玄, 徳納吉秀, 橋本 和仁

    第54回日本生物物理学会年会  2016年11月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    Molecular mechanism of proton coupled electron transfer in outer-membrane flavocytochrome

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  • シワネラ菌における外膜フラボシトクロムの電気的性質

    OKAMOTO, Akihiro

    AP-ISMET 2016  2016年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Mirobial current produciton reflects kinetic competition between extracellular electron transport and upstream reaction

    Saito Junki, OKAMOTO, Akihiro

    AP-ISMET 2016  2016年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 硫酸還元菌による電子引き抜き反応を媒介する外膜やナノワイヤー上のシトクロム

    OKAMOTO, Akihiro, Deng Xiao

    AP-ISMET 2016  2016年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 細胞外電子移動の電気化学的追跡

    OKAMOTO, Akihiro

    AP-ISMET 2016  2016年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • バイオプロセスを加速する細菌・電極界面の電気膜タンパク質

    岡本 章玄

    極限環境生物学会第17回シンポジウム  2016年11月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    細胞外電子移動を伴う嫌気呼吸のユニークな特徴

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  • 発現マッピング法による細菌叢電気相互作用の追跡と制御基盤の構築

    OKAMOTO, Akihiro

    「微生物叢と宿主の相互作用・共生の理解と、それに基づく疾患発症の  2016年12月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 口腔細菌による細胞外電子移動

    OKAMOTO, Akihiro

    日本化学会第97春季年会  2017年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 発電細菌Shewanellaの細胞外電子移動に伴う外膜シトクロム複合体の動的構造変化

    岡本 章玄

    蛋白研セミナー『構造を基盤とする蛋白質科学における未解決問題』  2016年3月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    発電細菌Shewanellaの細胞外電子移動に伴う外膜シトクロム複合体の動的構造変化

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  • Shewanellaをプラットフォームにした新規電気駆動反応系の探索

    岡本 章玄

    「電気と微生物」小集会  2016年3月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    Shewanellaをプラットフォームにした新規電気駆動反応系の探索

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  • Desulfovibrio ferrophilus IS5の外膜シトクロムを介した細胞外電子移動

    OKAMOTO, Akihiro, Deng Xiao, HASHIMOTO, Kazuhito

    ASM meeting 2016  2016年6月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Streptococcus mutant菌の細胞外電子移動によって促進される歯質う蝕

    岡本 章玄, ディビア ナラダス

    第58回歯科基礎医学会学術大会  2016年8月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    Cariogenicity of Streptococcus mutans UA159 in dental cavity is promoted by biofilm acidification via extracellular electron transfer

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  • 細胞外電子移動によって促進される歯質上バイオフィルムの酸性化

    OKAMOTO, Akihiro, Divya Naradasu

    AP-ISMET 2016  2016年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • プロトン移動によるフラビンを介したシワネラにおける細胞外電子移動の加速

    OKAMOTO, Akihiro, Tokunou Yoshihide

    AP-ISMET 2016  2016年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • エネルギー欠乏環境において膜シトクロムはエネルギー生産を可能にする

    OKAMOTO, Akihiro, Xiao, HASHIMOTO, Kazuhito

    環境微生物系学会合同大会2017  2017年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 円二色偏光を用いた外膜シトクロム構造のその場追跡法

    岡本 章玄, 徳納吉秀, 橋本 和仁

    第55回日本生物物理学会年会  2017年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    円二色偏光を用いた外膜シトクロム構造のその場追跡法

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  • 高分解能二次イオン質量分析法による電気細菌代謝の一細胞レベル追跡

    岡本 章玄, 橋本 和仁

    第55回 日本生物物理学会年会  2017年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    高分解能二次イオン質量分析法による電気細菌代謝の一細胞レベル追跡

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  • フラビン反応中心の細胞外電子移動を加速させる重要な構造要因

    OKAMOTO, Akihiro, HASHIMOTO, Kazuhito

    International society for microbial electrochemistry and tech  2017年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 環境技術としての微生物電極触媒:プロトン移動によって速度論制御される電流生成

    岡本 章玄, 徳納吉秀, 橋本 和仁

    Interdisciplinary Symposium for Up-and-coming Material Scientist  2017年8月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    環境技術としての微生物電極触媒:プロトン移動によって速度論制御される電流生成

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  • 外膜シトクロムをダイオード化させるリボフラビン結合

    OKAMOTO, Akihiro, Tokunou Yoshihide, HASHIMOTO, Kazuhito

    Extracellular Electron Transfer: Mechanisms and Opportunities  2017年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 硫酸還元細菌から発見された外膜シトクロムは直接電子移動を媒介する

    OKAMOTO, Akihiro, Xiao, HASHIMOTO, Kazuhito

    Extracellular Electron Transfer: Mechanisms and Opportunities  2017年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 鉄還元細菌Shewanellaによる細胞外 電子移動と共役した嫌気アンモニア酸化

    岡本 章玄, 橋本 和仁

    環境微生物系学会合同大会2017  2017年8月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    鉄還元細菌Shewanellaによる細胞外 電子移動と共役した嫌気アンモニア酸化

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  • 共役プロトン移動により速度論制御される微生物と電極間の電子移動反応

    岡本 章玄

    Recent Progress on Interfacial Energy Conversion  2017年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    共役プロトン移動により速度論制御される微生物と電極間の電子移動反応

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  • フラボシトクロムにおけるプロトン移動は微生物電子移動の律速過程である

    OKAMOTO, Akihiro, Tokunou Yoshihide, HASHIMOTO, Kazuhito

    2017 International Workshop on Electrified Interfaces for Energy  2017年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 外膜フラボシトクロム酵素を介したプロトン共役細胞外電子移動

    OKAMOTO, Akihiro, Tokunou Yoshihide, HASHIMOTO, Kazuhito

    24th International Symposium on Bioelectrochemistry and Bioenerg  2017年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 硫酸還元細菌による電子授受を可能にする外膜多核ヘム酵素

    OKAMOTO, Akihiro, Xiao, HASHIMOTO, Kazuhito

    International union of microbiological societies 2017  2017年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 生細胞内酵素反応速度の電気化学的測定法の開発

    岡本 章玄

    つくば医工フォーラム2017  2017年3月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    生細胞内酵素反応速度の電気化学的測定法の開発

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  • 口腔病原菌による細胞外電子移動過程

    OKAMOTO, Akihiro

    つくば医工フォーラム2017  2017年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 電子引き抜きを行う新規外膜シトクロム

    岡本 章玄

    日本化学会第97春季年会  2017年3月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    To test the extracellular electron uptake capability of D. ferrophilus IS5, we conducted electrochemical measurements using intact microbes in an anaerobic 3-electrode reactor with negative potential poised-ITO electrode served as a sole electron donor, and 20 mM sulfate served as a sole electron acceptor.

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  • 電流生成菌による一酸化窒素生成を伴うアンモニア酸化反応

    岡本 章玄

    日本化学会第97春季年会  2017年3月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    研究では、EET を行う鉄還元細菌 Shewanella oneidensis MR-1 を用いて、細胞外電子移動と共役 したアンモニア酸化反応を検討した。

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  • シワネラ菌による一酸化窒素生成を伴うアンモニア酸化反応

    OKAMOTO, Akihiro, HASHIMOTO, Kazuhito

    IUMS2017  2017年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 微生物外膜を横断する電子とプロトンの流れはATP合成を促進する

    岡本章玄, シャオ, 橋本和仁

    International union of microbiological societies 2017  2017年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 微生物外膜を横断する電子とプロトンの流れはATP合成を促進する

    OKAMOTO, Akihiro, Tokunou Yoshihide, HASHIMOTO, Kazuhito

    International union of microbiological societies 2017  2017年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Analysis on the single-cell metabolic pathway of dual isotope labeled bacteria with nanoscale secondary ion mass spectrometry

    岡本 章玄, 齋藤 淳貴

    日本微生物生態学会第 32 回沖縄大会  2018年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 微生物鉄腐食研究が与える異分野融合のチャンス

    岡本 章玄

    日本生物工学会2018年度大会  2018年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    近年、電気化学実験を行う生物系研究者が増えているが、電気化学を専門とする研究者から実験系と解釈における問題点を指摘されるシーンも見られる。異なる研究領域の研究者が異分野融合を進めていく上で、この様なズレは致命的である。そこで、非生物系の他学会で活躍する新進気鋭の若手研究者を講師として招き、初心者が間違えそうな例と共に、明日にでも実験を始められる基礎から、最新の異分野融合展開について講演を頂く。

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  • Proton-Coupled Extracellular Electron Transport via Microbial Outer Membrane Flavocytochromes

    岡本 章玄

    2018 MRS Fall Meeging & Exhibit  2018年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Low pH induced Extracellular Electron Transfer by an oral pathogen

    岡本 章玄, ナラダス ディビア

    Interdisciplinary Science & Technology for Safety and Quality of Life 9th Annual ISAJ Symposium  2018年12月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 微生物鉄腐食研究が進める異分野融合の近況

    岡本 章玄

    微生物腐食分科会  2018年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    微生物鉄腐食研究が進める異分野融合の近況

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  • Long-range electron transfer in the conductive duel species aggregates of sulphate reducing bacteria and iron reducing bacteria

    岡本 章玄, ムルガン ムラリダハラン

    10th Asian Symposium on Microbial Ecology  2018年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Membrane Cytochromes Enable Energy Acquisition in Energy-limited Environments

    岡本章玄, 鄧 驍

    2018 JSME annual meeting & 10th ASME  2018年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Synergetic extracellular electron transfer from dual species in anaerobic conductive sediment

    岡本 章玄

    17th International Symposium on Microbial Ecology  2018年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Simultaneous analysis of single-cell metabolic pathways and bacterial activity with nanoscale secondary ion mass spectrometry (NanoSIMS)

    岡本 章玄, 齋藤 淳貴

    17th International Symposium on Microbial Ecology  2018年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 発電する細菌のサイエンスとその利用の新展開

    岡本 章玄

    愛媛県バイオマス利活用促進連絡協議会  2019年2月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    発電菌による発電と発酵について

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  • Electrochemical ammonium oxidation with an electroactive microbe

    岡本 章玄, 齋藤 淳貴

    MANA International Symposium 2018  2018年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Acid stress induced Extracellular Electron Transfer by an oral pathogen Streptococcus Mutans UA159

    岡本 章玄, ナラダス ディビア

    MANA International Symposium 2018  2018年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Conformational change of multi-heme electron conduit in cytochromes c in whole-cell

    岡本 章玄, 徳納 吉秀

    JSPS 10th HOPE meeting  2018年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Molecular design of electrocatalysts towards enhancement of interfacial electron transport between microorganism and electrode

    橋本 和仁, 徳納 吉秀, 岡本 章玄

    日本化学会第98回春季年会  2018年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 生細胞を用いた円二色性測定による外膜シトクロムの構造追跡

    TOKUNOU, Yoshihide, OKAMOTO, Akihiro, HASHIMOTO, Kazuhito

    IGER International Symposium on Cell Surface Structures 2017  2017年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 微生物の電気代謝速度を制御する小分子の役割

    OKAMOTO, Akihiro

    IGER International Symposium on Cell Surface 2017  2017年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Currents in human mouth: Oral pathogen Capnocytophaga ochracea proceeds extracellular electron transportation

    岡本 章玄, Shu ZHANG

    MANA International Symposium 2018  2018年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Whole-cell Circular Dichroism Spectroscopy Reveals Redox-Triggered Conformational Change of Multi-Hemes Conduit in Cytochromes c

    岡本 章玄, 徳納 吉秀

    MANA International Symposium 2018 Towards Perceptive Nanomaterials, Devices and Systems  2018年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Perspective for fundamentals and applications in Microbially-induced Corrosion

    岡本 章玄

    Biocorrosion – any progress in reality? A Conceptual Workshop  2018年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Extracellular electron transport(EET) Recovers Fermentation suppressed by Highly Reductive Potential in Streptococcus mutans

    岡本 章玄, ナラダス ディビア

    32nd ANNUAL MEETING of JAPANESE SOCIETY for MICROBIAL ECOLOGY & 10th ASIAN SYMPOSIUM on MICROBIAL ECOLOGY(ASME)  2018年7月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Circular Dichroism spectroscopy for Engineered E.coli surface cytochrome detection

    岡本 章玄, ロン シズ

    ISMET7 International Society for Microbial Electrochemistry and Technology Global Conference  2019年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Low Extracellular Electron Transport Facilitate Fermentative Metabolism in oral Pathogen: Possibility of Electrical Symbiosis in Oral plaque

    岡本 章玄, ナラダス ディビア

    ISMET7 International Society for Microbial Electrochemistry and Technology Global Conference  2019年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Ubiquitous Transmembrane Electric Conduit in Microbial World

    岡本 章玄

    MANA- i-MATE Joint Symposium  2019年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 電気細菌による嫌気鉄腐食反応機構と応用へ向けた課題

    岡本 章玄

    NIMSインフラ構造材料パートナーシップ 2020年度第1回研究会  2020年8月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    電気細菌による嫌気鉄腐食反応機構と応用へ向けた課題

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  • 「生体における微粒子の機能と制御」多様な細胞外微粒子の生体機能を探る

    岡本 章玄

    第58回 日本生物物理学会年会  2020年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    シンポジウム / Symposium 共催:JSTさきがけ「生体における微粒子の機能と制御」 多様な細胞外微粒子の生体機能を探る Open up extracellular nanoparticles! -Their diversity and biodynamics- 演題番号 2S-14-3 2020/09/17(木)13:30~16:00

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  • Interplay of low electron export and redox-repressor rex in modulation of pathogen’s metabolism – a new form for antibiotic assessment

    岡本 章玄, ナラダス ディビア

    1st virutual meeting ISMET 2020  2020年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Effects of electric current on deep-sea hydrothermal vent Epsilonproteobacteria.

    岡本 章玄, 武藤 久

    マクロ生物学百花繚乱  2019年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • FeGenie: a bioinformatics tool and database to identify microbial iron-related genes and gene operons in genomes and metagenome assemblies

    Nancy Merino, 岡本 章玄

    The Gordon Research Seminar on Merging and Emerging Disciplines in Geobiology  2020年1月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Genomic Characterization of an Uncultivated Actinobacterial Acetogen from a Serpentine-Hosted Environment, Hakuba Happo Hot Springs

    Nancy Merino, 岡本 章玄

    The Gordon Research Seminar on Geobiology  2020年1月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 「運び屋」ではなく「触媒」として働く細菌膜小胞

    岡本 章玄

    第93回日本細菌学会総会  2020年2月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    最近、ヒト細菌叢において細胞外へと電子を輸送する電気細菌の存在が次々と報告されている。我々は、細菌による電子移動がバイオフィルムの形成や成熟化を促進するような仕組みが存在することを見出している。しかし、実際にバイオフィルム内での電子の流れを媒介する物質を実験的に特定することは極めて難しい。本研究では、口腔内細菌がバイオフィルム内において分泌している膜小胞が電子移動を媒介する触媒のような働きをすることを見出した。当日は、膜小胞や細菌を用いた電気化学や生化学解析、ならびにバイオフィルム内における膜小胞の働きを調べる新規方法論の開発に関しての展望を述べる。

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  • Transmembrane Electric Wire Synthesized in Living Bacteria

    岡本 章玄

    MANA International Symposium  2019年3月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • FeGenie: a bioinformatics tool and database to identify microbial iron-related genes and gene operons in genomes and metagenome assemblies

    Nancy Merino, 岡本 章玄

    2019 NeLLi – Symposium on New Lineages of Life  2019年4月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 口腔内細菌叢における細胞外電子移動に関する研究

    岡本 章玄

    第92回日本生化学会大会  2019年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    細胞表面の膜タンパク質を介して細胞内から外へと電子を移動する「細胞外電子移動(Extracellular Electron Transport, EET)能」は、細菌が広く有する能力でありエネルギー生成を担う機構として様々な自然環境における生態系を支えている[1]。近年、環境細菌に加えてヒト菌叢内からもEET能を有する細菌が見つかり始めており、しかも興味深いことにそれらはいずれも病原細菌である[2, 3]。EETと病原性の直接的な関係性は未だ解明されていないが、申請者らは病原細菌がバイオフィルムを発展・成熟させる上で重要な役割を果たしているとの仮説のもと4年前から口腔内病原細菌の電気化学的研究を行っている。複数種類の口内細菌を電気化学的に解析するといずれの病原細菌においても環境細菌とは異なる膜タンパク質を介したEET能が見出された。さらに、イオンクロマトグラフィーや二次元高分解能二次イオン質量分析による代謝解析を行うと、EETは細菌内レドックス恒常性の維持に寄与することで発酵反応を促進することが明らかとなった。当日の発表では、EETと共役して代謝を促進する遺伝子の普遍性や、歯垢バイオフィルム内細菌活性に対するEETの寄与に関しても詳細に議論する。

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  • Extracellular electron transport mechanism for microbial electrode catalysis

    岡本 章玄

    The 8th Asian Conference on Colloid & Interface Science  2019年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Synergetic current generation across conductive bacterial networks in biomineralized coculture

    岡本 章玄, ムルガン ムラリダハラン

    ISMET7 International Society for Microbial Electrochemistry and Technology Global Conference  2019年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Extracellular Electron Transport by Human Gut Bacteria: Electrochemical Techniques for Isolation and Characterization

    岡本 章玄, ミラン ワヒード

    ISMET7 International Society for Microbial Electrochemistry and Technology Global Conference  2019年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 発電細菌・固体界面における膜タンパクを介した電子とイオン移動研究の最前線

    岡本 章玄

    第15回固体イオニクスセミナー  2019年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    発電細菌と呼ばれる細菌が媒介する「有機物を酸化し、電極へと電子移動を行う反応」を用いた技術開発や基礎研究が盛んに行われている。この反応の魅力的な点は、一般的な無機アノード触媒とは異なり、多様な酵素群を有する細菌が種々の基質を分解しエネルギーを生み出す点にある。さらに、たとえ被毒して一時は失活したとしても、条件が揃えば自己再生・複製し半永久的に反応が進行し続ける。このような生きた触媒としての独特の特徴があるため、カソード空気電極と組み合わせた微生物燃料電池 (Microbial Fuel Cell [MFC])はエネルギー・環境工学分野において広く関心を集めており、キーワード検索でヒットする論文数は年々増加、2017年だけでも593報が報告されている(Web of Science [Thomas Reuters] 調べ)。 このような背景のもと私たちは最近、外膜シトクロムによる細胞外へのプロトン排出、すなわちプロトン駆動力(PMF)を貯めないことが重要な速度因子であることを示唆する現象を見出した。さらに、外膜シトクロム内のフラビン反応中心のプロトン化がEETの律速過程であることを突き止めた。

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  • In-Situ Biosynthetically Produced Iron Sulfide Nanocluster by Sulfate reducing bacteria Enhanced Anodic Current Generation in Microbial Fuel Cells

    ムルガン ムラリダハラン, ミラン ワヒード, 岡本 章玄, 増田 卓也, Dae Sung Lee

    5th International Water Industry Conference 2019  2019年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • In-Situ Biosynthetically Produced Iron Sulfide Nanocluster by Sulfate reducing bacteria Enhanced Anodic Current Generation in Microbial Fuel Cells

    岡本 章玄, ムルガン ムラリダハラン, 増田 卓也, Dae Sung Lee, ミラン ワヒード

    5th International Water Industry Conference 2019  2019年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Good and bad living electrode catalysts: Interfacial electron transfer mechanisms between bacteria and electrodes

    岡本 章玄

    5th International Water Industry Conference 2019  2019年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 「健全性崩壊をもたらす微生物による視認不可腐食の分子生物・電気化学的診断及 び抑制技術の開発」

    岡本 章玄

    2020年10月20日第1回腐食分科会  2020年10月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    「健全性崩壊をもたらす微生物による視認不可腐食の分子生物・電気化学的診断及 び抑制技術の開発」

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  • Extracellular Electron Transport Mechanisms by Sulfate-reducing Bacteria

    岡本 章玄

    2020KSBB Fall Meeting and International Symposium: Hybrid Conference  2020年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 外膜シトクロムを介した電子引き抜きによる微生物鉄腐食

    OKAMOTO, Akihiro, Deng Xiao, HASHIMOTO, Kazuhito

    Pacific Rim meeting on electrochemical and solid-state science  2016年10月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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産業財産権

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 感染を伴う創傷に対する電気殺菌を用いた革新的治療機器の開発

    研究課題/領域番号:24K22227  2024年6月 - 2026年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的研究(萌芽)

    柿花 隆昭, 菅野 恵美, 岡本 章玄

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    配分額:6370000円 ( 直接経費:4900000円 、 間接経費:1470000円 )

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  • 低張浸透圧バイオフィルム殺菌技術を用いた医療機器開発と国際展開

    2024年

    科学技術振興機構  産学が連携した研究開発成果の展開 大学発新産業創出基金事業 ディープテック・スタートアップ国際展開プログラム(D-Global) 

    岡本 章玄

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    新原理の低張浸透圧バイオフィルム殺菌技術を活用して、整形外科インプラント感染および創傷感染に対する治療機器を開発し、展開するグローバルスタートアップの設立を目指す。

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    J-GLOBAL

  • 鉄腐食細菌に殺菌剤耐性を与えるレドックス二次代謝物のデータ駆動探索法の開発

    研究課題/領域番号:22KK0242  2023年 - 2025年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A))

    岡本 章玄

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    配分額:15470000円 ( 直接経費:11900000円 、 間接経費:3570000円 )

    微生物鉄腐食の革新的オンサイトリスク評価技術の創生へ向けて、基課題では主要な原因である硫酸還元細菌(SRB)の鉄から電子を引き抜く反応を加速する可溶性レドックス分子のデータ駆動型探索を電気化学計測に基づいて進めている。薬剤耐性遺伝子群の発現がレドックス特性を有する二次代謝物によって制御される機構は多様な細菌で確認されているが、微生物鉄腐食の分野においては報告がない。申請者らは、殺菌剤を定期的に添加していても微生物腐食による事故が絶えない原因として、二次代謝物による薬剤耐性の活性化機構を着想した。本国際共同研究では、二次代謝物と薬剤感受性の研究において世界をリードしているDianne Newman教授と共に、SRBの殺菌剤耐性獲得とレドックス分子の関係に迫る。これまでに具体的には、薬剤耐性を活性化する分子を探索する電気化学手法の開発をモデル細菌系を用いて行ってきた。薬剤耐性タンパク質の活性を電気化学的に評価することが可能になっており、この手法を今後はSRBを含む細菌系へ適用していく予定である。また、Dianne Newman研究室において行っている緑膿菌の電気化学培養と、岡本らのハイスループット系の技術を組み合わせた新しい共同研究が展開している。この研究によって電気化学培養時に興味深い薬剤耐性を有することが新たにわかってきており、NIHの予算申請へ現在準備中である。また、本内容に関しては、すでに論文を投稿済みであり、二報目の論文投稿へ向けて準備を進めている。

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  • 微生物鉄腐食を加速する可溶性レドックス分子のデータ駆動型研究

    研究課題/領域番号:23K23532  2022年4月 - 2025年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    岡本 章玄, 今村 岳, Deng Xiao

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    配分額:17420000円 ( 直接経費:13400000円 、 間接経費:4020000円 )

    硫酸還元菌は、鉄パイプライン等の嫌気環境で鉄腐食を引き起こし、甚大な経済損失と事故を引き起こしている。暗所や視認困難な場所で起きる嫌気バイオ腐食を防ぐためには現場の採水試料を用いた加速試験法の開発が鍵となる。申請者らはこれまでに、電気化学と分子生物学手法を用いて硫酸還元菌が固体から電子を直接引き抜く「Extracellular Electron Uptake (EEU)」が鉄腐食速度と高い相関性を示すことを明らかにした。本研究では、EEUに基づくバイオ鉄腐食の速度論的理解・制御を通して、バイオ腐食細菌の加速試験開発へとつなげる。申請者らが独自に開発したハイスループット電気化学測定系にデータ駆動科学(ベイズ最適化)の手法を組み合わせることで、硫酸還元菌によるEEUを大幅加速する電子ミディエーターの分子構造を網羅的に探索・特定する。本年度は、保有分子のデータを取得し、ベイズ最適化を適用することで、電流値を大幅に加速する小分子を購入可能な分子群から特定するパイプラインを構築した。モデル細菌において、電流値を大幅に増大する分子群を比較したところ、レドックス電位のみならず膜透過性が重要な鍵であることが初めて見出された。また、このパイプラインを用いてSRBのEEU速度に影響を与える小分子を特定する実験を進めている。最も高い特性を示した分子に対して、今後、鉄腐食速度を確認し、有意な加速が可能か検証する。今年度、2報の論文を投稿しており、現在2報の論文を準備中である。

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  • 微生物鉄腐食を加速する可溶性レドックス分子のデータ駆動型研究

    研究課題/領域番号:22H02265  2022年4月 - 2025年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    岡本 章玄, 今村 岳, Deng Xiao

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    配分額:17420000円 ( 直接経費:13400000円 、 間接経費:4020000円 )

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  • 発電機能を持つ歯周病細菌におけると鉄イオン排出機構に関する研究

    研究課題/領域番号:21F21412  2021年11月 - 2024年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

    岡本 章玄, NARADASU DIVYA

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    配分額:2300000円 ( 直接経費:2300000円 )

    Bacterial outer membrane vesicles (OMVs) are spherical lipid bilayer nanostructures released by bacteria that facilitate oral biofilm formation via cellular aggregation and intercellular communication. Recent studies have revealed that Capnocytophaga ochracea is one of the dominant members of oral biofilms; however, their potential for OMV production has yet to be investigated. This study demonstrated the biogenesis of OMVs in C. ochracea associated with the concentration of unsaturated fatty acids of phosphatidylinositol (PI) and characterized the size and protein profile of OMVs produced at growth phases. Transmission electron microscopy showed isolated spherical structures from cells stained with heavy metals, indicating the production of OMVs with a size ranging from 25 to 100 nm. Lipidome analysis revealed the presence of phosphatidic acid, phosphatidylethanolamine, phosphatidylcholine, and PI as the main lipids. Some unsaturated fatty acids of PI were present specifically in OMV and little in the outer membrane, suggesting that OMVs are generated from a specific region of the membrane through blebbing rather than a random process such as cell lysis. Furthermore, the lack of similar PI accumulation in the OMV of Porphyromonas gingivalis suggests that C. ochracea has a different biogenesis mechanism. The present study provides a basis for further understanding the roles of C. ochracea OMVs in oral biofilms as well as systemic diseases that C. ochracea involves.

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  • 持続可能な肥料生産へ向けた電気細菌によるアンモニア生合成反応の高速化に関する研究

    研究課題/領域番号:20F20105  2020年11月 - 2023年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

    岡本 章玄, LONG XIZI

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    配分額:2300000円 ( 直接経費:2300000円 )

    One progress on the influence of membrane to the MtrC, in charge of cross membrane electron transfer, was explored in strain Shewanella onedensis MR-1 (MR-1). The MR-1 strain was pre-cultured at 4 °C and 30 °C to initiate differentiation of membrane composition. The whole-cell difference electrochemical assay of wild-type and mutant strains lacking MtrC under 25 °C suggested that the rate of EET via MtrC increased approximately 18 times. Circular dichroism spectroscopy of whole cell firstly unveiled that the molar exciton coupling coefficient for inter-heme interaction in MtrC increased in MR-1 pre-cultured at 4°C than in those pre-cultured at 30 °C. Our work suggest that membrane modification may be a novel strategy for improving the uptake of the electrons of cells and columbic efficiency that helped enhancing the nitrogen fixing by rapid injection.
    Moreover, the high throughput electrochemical system we proposed to screen the nitrogen fixing bacteria is also working well. Initiated with mutant’s library of MR-1, we verified our device and investigated the effect of unannotated proteins on extracellular electron transport. The random transposon mutant’s library was constructed by two methods of cooperation and self-construction. Combined with the customized 96-channel electrochemical system, six genes were discovered to be impactful to the electron transfer process, the high-throughput screening part is still in progress. This study provides an experimental means for the construction of a mutant library in this project to identify the nitrogen fixing pathway.

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  • ハイスループット電気化学培養法による電気細菌の同時複数単離法の開発

    研究課題/領域番号:20H05590  2020年4月 - 2022年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    岡本 章玄

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    配分額:8320000円 ( 直接経費:6400000円 、 間接経費:1920000円 )

    電気細菌や発電細菌と呼ばれる細胞外固体と直接電子のやり取り「細胞外電子移動(Extracellular Electron Transport, EET)」を行い代謝する細菌が特に熱水噴出孔などの深海生態系において注目されており、電気培養によって未分離の細菌を集積・単離する試みが盛んに行われている。しかし、電気化学測定系の制約 から単離効率が極めて低いという長年の課題があった。本研究では、フローサイトメトリーによって1細菌に分離してから電極培養するハイスループット電気微生物培養法の開発を行なった。これまでに、環境サンプルから電極培養で環境中から電気細菌を単離することに成功したが、96ウェルプレート上で電流生成が観測されるウェル数が少ないという問題点があった。各ウェルの中央に配置されている電極上に細菌が到達しない場合に電気培養が進まないことが考えられたため、電気細菌表面に選択的に吸着する磁性ナノ粒子を開発した(特許出願済み)。ナノ粒子を用いることで、環境中の電気細菌が濃縮され高い電流生成が示されることを確認した。さらに、ナノ粒子が吸着した後にも細菌が電流生成を行うことが確認できたため、電極培養へ直接アプライできることが示された。今後は、磁性ナノ粒子を用いて電気細菌を濃縮した後に、電極上に磁力で誘導、電気培養を行うことで1細胞電極培養の成功率を高める予定である。加えて、単離した細菌株の新種提唱の論文と電気化学解析を行なった論文の2報を準備中である。

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  • 酸化還元特性を持つ膜小胞によるバイオフィルム活性の制御

    研究課題/領域番号:19F19406  2019年11月 - 2022年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

    岡本 章玄, MIRAN WAHEED

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    配分額:2300000円 ( 直接経費:2300000円 )

    The electrochemical reactor systems currently used for current production and drug testing involve relatively large volumes, making these systems infeasible for high-throughput screening of potential antimicrobials. We used screen-printed electrodes or multi-well electrode systems that require minimum amounts of sample and antimicrobials. Such systems that exploit the electrogenic activity of pathogens could fast-track the discovery of antibiofilm drugs, as a large library of compounds could be rapidly screened. This concept could serve as a generally applicable technology for evaluating the efficacy of antimicrobials, as well as the selection of appropriate drugs or treatment regimens. Our works extended the boundaries of EET field to other niches such as human pathogens. The orthologues of the identified EET genes in human pathogens are present in hundreds of species, thus EET activity likely occurred in an evolutionarily diverse subset of bacteria. Consequently, our research can help screen the effects of antimicrobials on biofilm activity by employing the current producing capability in wide range of electroactive pathogens.

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  • 発酵代謝を加速する電極触媒細菌のハイブリッド呼吸の分子機構解明と制御

    研究課題/領域番号:17H04969  2017年4月 - 2021年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究(A)

    岡本 章玄

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    配分額:23920000円 ( 直接経費:18400000円 、 間接経費:5520000円 )

    本研究では、発見した「電気細菌Shewanellaによる電極上での発酵代謝の高速駆動」において鍵となる「細胞外プロトン排出」の多角的解析を行い、その機構の解明、ならびに電子移動速度の制御を達成した。さらに、バイオプロセスのモデル系(大腸菌)での電極による代謝反応の高速化を実現した。本成果は、薬剤やバイオプラスティック等の微生物によるな物質・材料生産の高速化に対して新しい方法論を提供した。

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  • in-vivo微生物電気化学を使った好アルカリ細菌のプロトン集積機構の研究

    研究課題/領域番号:26810085  2014年4月 - 2016年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究(B)

    岡本 章玄

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    配分額:4160000円 ( 直接経費:3200000円 、 間接経費:960000円 )

    pH12の極限環境にアノード電極を電子受容体とするオンサイト電極システムを構築し、電極上に集積された微生物叢からから世界初となる細胞外電子伝達能を有する好アルカリ性グラム陽性細菌を単離し、電気化学的評価、ならびに全ゲノム解読を行った。また、生細胞を用いてペリプラズム内のプロトン濃度を追跡する技術を開発することで、細胞外電子移動過程が電子と共にプロトンを細胞外へと放出することを示唆する結果を得た。

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  • in-vivo微生物電気化学を使った好アルカリ細菌のプロトン集積機構の研究

    研究課題/領域番号:25888006  2013年8月 - 2015年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  研究活動スタート支援

    岡本 章玄

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    配分額:2730000円 ( 直接経費:2100000円 、 間接経費:630000円 )

    プロトン(H+)は電子移動とカップルするため、その局在濃度は人工光合成や燃料電池の触媒効率に直接作用する。本研究の目的は、極限環境微生物に見られる細胞外H+濃度に逆相関して細胞膜上により多くH+を集積する機構の解明である。極限菌の一種である好アルカリ菌は、細胞内部に較べて膜外のpHがより高い条件において、膜上タンパク質に電子を貯め込むことでH+を局在化させ、ATPを合成すると提案されている。しかし、呼吸鎖における電荷の局在性を確かめるには、律速電子移動過程の特定が不可欠となるが、既存の単独・単離タンパク系での検討は極めて難しい。本研究では、電流生成菌を生きたまま電気化学システムに適用する「微生物電気化学」を用いて、申請者が発見した初となる好アルカリ電流生成菌と電極の界面電子移動と細胞内ATP濃度をin-vivo同時追跡することで、高アルカリ条件に逆相関するH+局在機構に迫ることを目指す。本年度は、(1)好アルカリ電流生成菌の連続希釈法による単離、(2)ゲノム塩基配列の決定、解析を行うことを研究計画として掲げていたが、申請者が米国研究機関で集積した微生物が全く増殖しなくなり再び菌体の採取から行うこととなった。そこで、再現性を確認する意味も込めてサンフランシスコ山中のpH12の極限環境に再び電極を設置し、採集したサンプルを米国実験室で電極培養すると以前観測されたように微生物の代謝に由来する電流値の増加が確認された。電極を日本に輸送し、立ち上げた嫌気ボックス内で電極培養実験を行なうと、最初は輸送中の酸素混入によるダメージからから電流値がほとんど観測されなかったが、徐々に電流値の上昇が観測された。現在、単離に向けて微生物を集積中である。

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  • 細胞外電子移動を基軸とした生体電子移動論の開拓

    研究課題/領域番号:24000010  2012年 - 2016年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別推進研究

    橋本 和仁, 中村 龍平, 中西 周次, 石原 一彦, 但馬 敬介, 岡本 章玄, 神谷 和秀

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    配分額:512850000円 ( 直接経費:394500000円 、 間接経費:118350000円 )

    細胞外電子移動ダイナミクスの追跡等を通してその分子機構を明らかにし、細胞外電子移動の制御による代謝の可逆制御と集団的活性化を実現した。さらに細胞外電子移動能を有する微生物が環境中に広く分布していることを見出すと共に、新しい電子伝達分子の開発により本来細胞外電子移動能を持たないヒト細胞等へその概念を拡張した。こうした細胞外電子移動を基軸とした生体電子移動論の学理構築を通して、体内時計やガン細胞活性の計測・制御、そして電気に支えられた新たな代謝・生態系の提唱など、多岐に渡る分野に対して新しい方法論や視点・切り口を提供した。

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