2025/09/07 更新

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トウ タイコ
藤 泰子
TO TAIKO
所属
生命理工学院 准教授
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准教授
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研究分野

  • ライフサイエンス / ゲノム生物学

経歴

  • 東京工業大学   生命理工学院   准教授

    2023年4月 - 現在

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論文

  • Arabidopsis SDG proteins mediate Polycomb removal and transcription-coupled H3K36 methylation for gene activation

    Nobutoshi Yamaguchi, Wang Yicong, Masato Abe, Yuka Kadoya, Takeru Saiki, Kanae Imai, Xuejing Wang, Taiko To, Soichi Inagaki, Takamasa Suzuki, Tetsuji Kakutani, Toshiro Ito

    2024年9月

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    出版者・発行元:Research Square Platform LLC  

    Abstract

    Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) recognizes Polycomb response elements (PREs) and catalyzes trimethylation of histone H3 on lysine 27 (H3K27me3) for gene silencing. This silencing is counteracted by H3K36 methylation for epigenetic activation of gene expression. Here, we show that the Arabidopsis thaliana H3K36 methyltransferases SET DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 7 (SDG7) and SDG8 antagonize PRC2-mediated silencing and establish H3K36 methylation patterns with the general transcription machinery. The sdg7 sdg8 double mutant shows developmental defects and lower H3K36me2 and H3K36me3 levels. SDG7 preferentially binds near PREs, but SDG8 is recruited to H3K36 methylation peaks. The sdg7 sdg8 phenotypes are partially rescued by loss of Polycomb function. SDG7 overlaps with PRC2 and its recruiters on chromatin and evicts them from shared target genes when conditionally induced. SDG8 and RNA Polymerase II associate at SDG- and RNA POLYMERASE II ASSOCIATED FACTOR 1 complex-regulated targets for H3K36 methylation and transcription. These results suggest that SDG proteins evict PRC2 from PREs to prevent H3K27me3 deposition and activate target genes via transcription-coupled H3K36 methylation.

    DOI: 10.7554/eLife.100905.1

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    その他リンク: https://www.researchsquare.com/article/rs-3988955/v1.html

  • Simple and universal function of acetic acid to overcome the drought crisis 査読

    Toru Kudo, Taiko Kim To, Jong-Myong Kim

    Stress Biology   3 ( 1 )   2023年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    Abstract

    Acetic acid is a simple and universal compound found in various organisms. Recently, acetic acid was found to play an essential role in conferring tolerance to water deficit stress in plants. This novel mechanism of drought stress tolerance mediated by acetic acid via networks involving phytohormones, genes, and chromatin regulation has great potential for solving the global food crisis and preventing desertification caused by global warming. We highlight the functions of acetic acid in conferring tolerance to water deficit stress.

    DOI: 10.1007/s44154-023-00094-1

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    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s44154-023-00094-1/fulltext.html

講演・口頭発表等

  • シロイヌナズナのトランスポゾン識別とヘテロクロマチン形成機構 招待

    藤泰子

    第7回転移因子研究会  2025年9月 

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    会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 遺伝子の運命を決める エピ遺伝の仕組み 招待

    藤泰子

    国際メンタリングワークショップJoshikai in Fukushima2023  2023年7月 

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    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

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  • シロイヌナズナはトランスポゾンと遺伝子をどのように識別するのか 招待

    藤泰子

    第6回転移因子研究会  2023年8月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 植物のエピゲノム修飾間クロストークがエピゲノムパターン形成を駆動する 招待

    藤泰子

    第95回遺伝学会 シンポジウム2「非ゲノム情報複製機構による生命現象の制御」  2023年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • Epigenetic mechanisms in plants 招待

    Taiko Kim To

    ASEAN-Japan International Research Symposium for Life Science and Technology  2023年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 植物のエピゲノムパターン構築機構の解明と医療応用の可能性 招待

    藤泰子

    第2回 東京工業大学生命理工学院・東京医科歯科大学難治疾患研究所 教員交流シンポジウム  2024年4月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • シロイヌナズナの乾燥耐性機構解明と継世代的エピゲ ノム動態の遺伝解析 招待

    藤泰子

    よんもくフォーラム  2024年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • Crosstalk among epigenetic marks during establishment of heterochromatin 招待

    Taiko Kim To, Shoko Oda, Tetsuji Kakutani

    International Conference on Arabidopsis Research  2023年6月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 植物のエピゲノム修飾間クロストークがエピゲノムパターン形成を駆動する 招待

    藤泰子

    第16回エピジェネティクス研究会  2023年6月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • Crosstalk between CG and non-CG DNA methylation drives plant epigenomic pattern formation

    Taiko Kim To, Chikae Yamasaki, Shoko Oda, Sayaka Tominaga, Shumpei Takeuhci, Tetsuji Kakutani

    The 2nd International Symposium on REPLICATION of NON GENOME 'Cutting Edge of Epigenetics'  2023年6月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • 対立するヒストンH2Aバリアントと自律的なヘテロクロマチン形成がシ ロイヌナズナのエピゲノムパターンを形成する 招待

    藤泰子

    日本分子生物学会第48回大会シンポジウム 転移因子コードが誘導する核内3次元構造形成メカニズムの理解  2025年12月 

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    会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • シロイヌナズナのエピゲノムパターン形成におけるヒストンH2Aバリアントの寄与

    藤泰子

    日本遺伝学会シンポジウム 植物エピジェネティクス:分子から自然集団  2025年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

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  • DNA Methylation Establishment at TEs 招待

    Keystone Symposia, Plant Epigenetics and Epigenome Engineering  2025年10月 

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    会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • Target selection and environmental stress control of epigenetic modifications in plants 招待

    International Genetics Federation (IGF) Asia Pacific Genetics Seminar Series  2025年5月 

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    会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • 植物におけるエピジェネティック修飾のゲノム内パターン形成の仕組み 招待

    藤泰子

    日本エピジェネティクス研究会年会  2025年6月 

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    会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • How plants identify transposons and genes ? 招待

    2025年4月 

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    会議種別:口頭発表(招待・特別)  

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  • Target selection and environmental stress control of epigenetic modifications in plants 招待

    OIST seminar  2025年6月 

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    会議種別:公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等  

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  • Target selection and environmental stress control of epigenetic modifications in plants

    2025年8月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 植物はトランスポゾンと遺伝⼦をどのように識別するのか 招待

    藤泰子

    日本分子生物学会 シンポジウム3AS-03  2024年11月 

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  • 遺伝子抑制に重要なエピジェネティック修飾の標的選択と環境ストレス制御 招待

    藤泰子

    お茶の水大学クリスマスセミナー  2024年12月 

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  • 植物はトランスポゾンと遺伝⼦をどのように識別するのか 招待

    藤泰子

    進化学セミナー  2024年12月 

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  • シロイヌナズナの 乾燥耐性機構解明と継世代的エピゲ ノム動態の遺伝解析 招待

    木原生研セミナー  2024年10月 

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  • 植物におけるエピジェネティック修飾のゲノム内パターン形成の仕組み 招待

    藤泰子

    ミニシンポジウム「シロイヌナズナエピジェネティクスの現在と未来」  2025年3月 

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  • 遺伝子抑制に重要なエピジェネティック修飾の標的選択と環境ストレス制御 招待

    藤泰子

    京都大学化学研究所セミナー  2025年3月 

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • エピゲノムパターン構築に不可欠な遺伝子と有害配列の識別メカニズムの解明

    研究課題/領域番号:22K06180  2022年4月 - 2025年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    藤 泰子

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    配分額:4160000円 ( 直接経費:3200000円 、 間接経費:960000円 )

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  • DNAメチル化によるゲノム情報安定化機構の解明

    研究課題/領域番号:19H05740  2019年6月 - 2024年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    中西 真, 藤 泰子, 鵜木 元香

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    配分額:171600000円 ( 直接経費:132000000円 、 間接経費:39600000円 )

    中西は、DNA複製過程における岡崎フラグメント連結がアフリカツメガエル卵細胞抽出液において再構成可能であることを見出した。この系を用いて、解析したところLIGは岡崎フラグメントの連結に重要な役割を果たしているが、必須の因子ではないことがわかった。LIG1欠損下においては、LIG3/XRCC1複合体が岡崎フラグメント連結不備により生じるDNA一本鎖切断を認識して相補的に岡崎フラグメント連結を触媒することがわかった。またこの際、PARPによるヒストンH3分子のPAR化分子マーカーとして機能することがわかった。本研究成果はNucleic Acid Research誌に掲載予定となっている。藤は、DNAメチル化の消失がDNA複製阻害時DNA傷害感受性に影響するシロイヌナズナゲノム領域の同定を行った。また、これまで遺伝子内DNAメチル化の確立過程については謎であったが、藤らは遺伝子内DNAメチル化の確立過程を知る手がかりとしてトランスポゾン遺伝子をモデルケースとしたDNAメチル化変異体交配系の解析を行い、論文をNature Plants誌に発表した。鵜木は、ICF症候群では、CDCA7及びHELLSの変異により、DNMT1/UHRF1維持DNAメチル化複合体が新規合成DNA鎖上に集積できなくなる事で、ペリセントロメア反復配列の低メチル化が起こり、これが異常な転写とRループ形成を引き起こす事でDNA損傷が惹起され、染色体が不安定化する事を見出した。本研究成果はScientific Reports誌に掲載された。

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