研究者詳細 - 平沢　敬

2026/01/09 更新

写真a

ヒラサワ　タカシ

平沢　敬

HIRASAWA TAKASHI

所属

生命理工学院准教授

外部リンク

学位

博士 (工学) （ 2002年3月）

研究キーワード

代謝工学
応用微生物学

研究分野

ライフサイエンス / 応用微生物学
ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学

学歴

東京工業大学大学院生命理工学研究科バイオテクノロジー専攻博士後期課程

1999年4月 - 2002年3月

　詳細を見る

researchmap
東京工業大学大学院生命理工学研究科バイオテクノロジー専攻修士課程

1997年4月 - 1999年3月

　詳細を見る

researchmap
東京理科大学理工学部応用生物科学科

1993年4月 - 1997年3月

　詳細を見る

researchmap

経歴

東京科学大学生命理工学院准教授

2024年10月 - 現在

　詳細を見る

国名：日本国

researchmap
東京工業大学生命理工学院准教授

2016年4月 - 2024年9月

　詳細を見る

researchmap
東京工業大学大学院生命理工学研究科准教授

2013年9月 - 2016年3月

　詳細を見る

researchmap
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻助教

2007年4月 - 2013年8月

　詳細を見る

researchmap
慶應義塾大学先端生命科学研究所特別研究助手

2005年5月 - 2007年3月

　詳細を見る

researchmap
大阪大学大学院工学研究科博士研究員

2002年4月 - 2005年4月

　詳細を見る

researchmap

▼全件表示

所属学協会

日本ゲノム微生物学会

　詳細を見る

researchmap
日本生物工学会

　詳細を見る

researchmap
日本農芸化学会

　詳細を見る

researchmap

論文

Enhancement of ergothioneine production in Corynebacterium glutamicum by increasing osmotic pressure. 査読国際誌

Yuno Takahashi, Takashi Hirasawa

Applied microbiology and biotechnology 109 ( 1 ) 255 - 255 2025年12月

　詳細を見る

担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Ergothioneine (EGT), which exhibits strong antioxidant properties, is an amino acid derivative with a betaine structure. Currently, studies have examined EGT import systems and its physiological roles in various organisms. Despite the broad applicability of EGT, industrial production with high productivity has not yet been achieved. In this study, we aimed to develop fermentative production methods for EGT using Corynebacterium glutamicum as a host and successfully achieved the highest yield of EGT (459 mg L-1) reported to date. A cysteine-producing strain C. glutamicum CYS-2, which was constructed in a previous study, was engineered to enhance the biosynthesis of histidine and S-adenosylmethionine, both of which, along with cysteine, are required for EGT production. Additionally, heterologous metabolic pathways for EGT biosynthesis from Mycolicibacterium smegmatis and Methylobacterium pseudosasicola were introduced into the engineered strain, which was designated CHS2. In batch cultivation, the CHS2 strain produced more EGT than the CYS-2 strain harboring the same EGT biosynthesis pathway. Interestingly, batch cultivation of the CHS2 strain under high osmotic pressure conditions prolonged the time for EGT production and increased the intracellular accumulation of EGT. These results suggest that increasing osmotic pressure together with engineering the biosynthesis of cysteine, histidine, and S-adenosylmethionine is an effective strategy for enhancing EGT production in recombinant C. glutamicum harboring heterologous EGT biosynthesis pathways. KEY POINTS: • Ergothioneine production in C. glutamicum was enhanced by metabolic engineering. • Osmotic pressure affects ergothioneine production in engineered C. glutamicum. • Ergothioneine may function as a compatible solute in C. glutamicum.

DOI： 10.1007/s00253-025-13639-3

PubMed

researchmap
Examination of the effect of HOG1 deletion on glucose fermentation in Saccharomyces cerevisiae. 査読国際共著国際誌

Nunthaphan Vikromvarasiri, Ryosuke Mitsui, Takashi Hirasawa, Akihiko Kondo, Tomokazu Shirai

Bioresource technology 434 132788 - 132788 2025年6月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

HOG1 encodes a mitogen-activated protein kinase in Saccharomyces cerevisiae and plays a crucial role in the high osmolarity glycerol pathway during the osmotic stress response. HOG1 loss improves glycerol utilization in yeast; however, its effects on the growth and fermentation profiles during glucose cultivation remain unexplored. Therefore, this study aimed to explore the effects of HOG1 deletion on glucose fermentation. HOG1 deletion led to enhanced glucose utilization and ethanol production by 14.30 % compared to the wild-type strain. Glycerol, acetate, and 2,3-butanediol levels were decreased in the Δhog1 strain. The loss of HOG1 function prevented resistance to high osmotic pressure resulting from high initial glucose fermentation; resistance was restored and enhanced by intermittent feeding. Key genes in central metabolism were deleted to investigate metabolic shifts further. PDC1 and ADH1 deletion induced NADH accumulation and redox imbalance, resulting in GPD2 primarily driving glycerol production. Elucidating the role of HOG1 in glucose fermentation offers novel insights into yeast physiology, with potential applications in biotechnology and industrial processes.

DOI： 10.1016/j.biortech.2025.132788

PubMed

researchmap
Mutations in the ilvN gene mitigate growth inhibitory effect of cysteine in Corynebacterium glutamicum. 査読国際誌

Kazuho Matsuhisa, Katsuhiro Ogawa, Kento Komata, Takashi Hirasawa

Applied microbiology and biotechnology 109 ( 1 ) 61 - 61 2025年3月

　詳細を見る

担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Cysteine, a common amino acid used in food, cosmetic, and pharmaceutical industries, has a growth inhibitory effect. This growth inhibition by cysteine poses a problem, as the production of cysteine using microbial cells results in decreased cell growth and cysteine productivity. The underlying mechanism of growth inhibition by cysteine is unclear. This study aims to understand the mechanism of growth inhibition by cysteine in Corynebacterium glutamicum. To do this, cysteine-resistant mutants of C. glutamicum were isolated based on adaptive laboratory evolution (ALE) and their characteristics were analyzed. Genome resequencing revealed that mutations in the open reading frame of the ilvN gene encoding the regulatory small subunit of acetohydroxyacid synthase (AHAS), which is involved in branched-chain amino acid biosynthesis, were found in ALE cell populations and the isolated cysteine-resistant mutants. The ilvN mutations which are responsible for increased valine production resulted in improved cell growth in the presence of cysteine. Moreover, the addition of valine to the culture medium mitigated growth inhibition by cysteine, whereas the addition of leucine and isoleucine showed a slight mitigation. Additionally, the activity of AHAS from C. glutamicum was inhibited by cysteine, whereas AHAS from the strains carrying ilvN mutations exhibited resistance to cysteine. These results indicate that growth inhibition by cysteine is caused by perturbations in the biosynthesis of branched-chain amino acids, particularly valine in C. glutamicum. Furthermore, the cysteine-resistant mutants obtained by ALE demonstrated enhanced cysteine production as production hosts, suggesting that cysteine resistance is a useful phenotype for cysteine production in C. glutamicum. KEY POINTS: • Cysteine-resistant mutants of C. glutamicum obtained by ALE were analyzed. • Perturbation of valine biosynthesis by cysteine results in growth inhibition in C. glutamicum. • Cysteine resistance is a useful phenotype for cysteine production by C. glutamicum.

DOI： 10.1007/s00253-025-13444-y

PubMed

researchmap
Production of aromatic amino acids and their derivatives by Escherichia coli and Corynebacterium glutamicum. 招待査読国際誌

Takashi Hirasawa, Yasuharu Satoh, Daisuke Koma

World journal of microbiology & biotechnology 41 ( 2 ) 65 - 65 2025年2月

　詳細を見る

担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Demand for aromatic amino acids (AAAs), such as L-phenylalanine, L-tyrosine, and L-tryptophan, has been increasing as they are used in animal feed and as precursors in the synthesis of industrial and pharmaceutical compounds. These AAAs are biosynthesized through the shikimate pathway in microorganisms and plants, and the reactions in the AAA biosynthesis pathways are strictly regulated at the levels of both gene expression and enzyme activity. Various attempts have been made to produce AAAs and their derivatives using microbial cells and to optimize production. In this review, we summarize the metabolic pathways involved in the biosynthesis of AAAs and their regulation and review recent research on AAA production using industrial bacteria, such as Escherichia coli and Corynebacterium glutamicum. Studies on fermentative production of AAA derivatives, including L-3,4-dihydroxyphenylalanine, tyrosol, and 3-hydroxytyrosol, are also discussed.

DOI： 10.1007/s11274-025-04264-3

PubMed

researchmap
Biotin concentration affects anaplerotic reactions functioning in glutamic acid production in Corynebacterium glutamicum 査読

Takako Ochiai, Masaaki Wachi, Takashi Hirasawa

Microbiology 170 ( 10 ) 001507 2024年10月

　詳細を見る

担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Microbiology Society

The study investigates the effect of biotin concentration on the role of anaplerotic reactions catalysed by pyruvate carboxylase (PC) and phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC) in glutamic acid production by Corynebacterium glutamicum. C. glutamicum requires biotin for its growth, and its glutamic acid production can be induced by the addition of Tween 40 or penicillin or by biotin limitation. The biotin enzyme PC and the non-biotin enzyme PEPC catalyse two anaplerotic reactions to supply oxaloacetic acid to the TCA cycle in C. glutamicum. Therefore, they are crucial for glutamic acid production in this bacterium. In this study, we investigated the contribution of each anaplerotic reaction to Tween 40- and penicillin-induced glutamic acid production using disruptants of PEPC and PC. In the presence of 20 µg l^–1 biotin, which is sufficient for growth, the PEPC-catalysed anaplerotic reaction mainly contributed to Tween 40- and penicillin-induced glutamic acid production. However, when increasing biotin concentration 10-fold (i.e. 200 µg l^–1), both PC- and PEPC-catalysed reactions could function in glutamic acid production. Western blotting revealed that the amount of biotin-bound PC was reduced by the addition of Tween 40 and penicillin in the presence of 20 µg l^–1. However, these induction treatments did not change the amount of biotin-bound PC in the presence of 200 µg l^–1 biotin. These results indicate that both anaplerotic reactions are functional during glutamic acid production in C. glutamicum and that biotin concentration mainly affects which anaplerotic reactions function during glutamic acid production.

DOI： 10.1099/mic.0.001507

researchmap
Metabolic engineering with adaptive laboratory evolution for phenylalanine production by Corynebacterium glutamicum 査読

Yukio Tachikawa, Miki Okuno, Takehiko Itoh, Takashi Hirasawa

Journal of Bioscience and Bioengineering 137 ( 5 ) 344 - 353 2024年5月

　詳細を見る

担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2024.01.006

researchmap
Loss of function of Hog1 improves glycerol assimilation in Saccharomyces cerevisiae 査読

Masato Sone, Kantawat Navanopparatsakul, Shunsuke Takahashi, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa

World Journal of Microbiology and Biotechnology 39 ( 10 ) 2023年7月

　詳細を見る

担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

Abstract

We previously isolated a mutant of Saccharomyces cerevisiae strain 85_9 whose glycerol assimilation was improved through adaptive laboratory evolution. To investigate the mechanism for this improved glycerol assimilation, genome resequencing of the 85_9 strain was performed, and the mutations in the open reading frame of HOG1, SIR3, SSB2, and KGD2 genes were found. Among these, a frameshift mutation in the HOG1 open reading frame was responsible for the improved glycerol assimilation ability of the 85_9 strain. Moreover, the HOG1 gene disruption improved glycerol assimilation. As HOG1 encodes a mitogen-activated protein kinase (MAPK), which is responsible for the signal transduction cascade in response to osmotic stress, namely the high osmolarity glycerol (HOG) pathway, we investigated the effect of the disruption of PBS2 gene encoding MAPK kinase for Hog1 MAPK on glycerol assimilation, revealing that PBS2 disruption can increase glycerol assimilation. These results indicate that loss of function of Hog1 improves glycerol assimilation in S. cerevisiae. However, single disruption of the SSK2, SSK22 and STE11 genes encoding protein kinases responsible for Pbs2 phosphorylation in the HOG pathway did not increase glycerol assimilation, while their triple disruption partially improved glycerol assimilation in S. cerevisiae. In addition, the HOG1 frameshift mutation did not improve glycerol assimilation in the STL1-overexpressing RIM15 disruptant strain, which was previously constructed with high glycerol assimilation ability. Furthermore, the effectiveness of the HOG1 disruptant as a bioproduction host was validated, indicating that the HOG1 CYB2 double disruptant can produce L-lactic acid from glycerol.

DOI： 10.1007/s11274-023-03696-z

researchmap

その他リンク： https://link.springer.com/article/10.1007/s11274-023-03696-z/fulltext.html
Ergothioneine production by Corynebacterium glutamicum harboring heterologous biosynthesis pathways 査読

Takashi Hirasawa, Yuki Shimoyamada, Yukio Tachikawa, Yasuharu Satoh, Yusuke Kawano, Tohru Dairi, Iwao Ohtsu

Journal of Bioscience and Bioengineering 135 ( 1 ) 25 - 33 2023年1月

　詳細を見る

担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Elsevier BV

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2022.10.002

researchmap
Adaptive Laboratory Evolution of Microorganisms: Methodology and Application for Bioproduction. 招待査読国際誌

Takashi Hirasawa, Tomoya Maeda

Microorganisms 11 ( 1 ) 2022年12月

　詳細を見る

担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Adaptive laboratory evolution (ALE) is a useful experimental methodology for fundamental scientific research and industrial applications to create microbial cell factories. By using ALE, cells are adapted to the environment that researchers set based on their objectives through the serial transfer of cell populations in batch cultivations or continuous cultures and the fitness of the cells (i.e., cell growth) under such an environment increases. Then, omics analyses of the evolved mutants, including genome sequencing, transcriptome, proteome and metabolome analyses, are performed. It is expected that researchers can understand the evolutionary adaptation processes, and for industrial applications, researchers can create useful microorganisms that exhibit increased carbon source availability, stress tolerance, and production of target compounds based on omics analysis data. In this review article, the methodologies for ALE in microorganisms are introduced. Moreover, the application of ALE for the creation of useful microorganisms as cell factories has also been introduced.

DOI： 10.3390/microorganisms11010092

PubMed

researchmap
Constitutive expression of the global regulator AbrB restores the growth defect of a genome-reduced Bacillus subtilis strain and improves its metabolite production. 査読国際誌

Junya Yamamoto, Onuma Chumsakul, Yoshihiro Toya, Takuya Morimoto, Shenghao Liu, Kenta Masuda, Yasushi Kageyama, Takashi Hirasawa, Fumio Matsuda, Naotake Ogasawara, Hiroshi Shimizu, Ken-Ichi Yoshida, Taku Oshima, Shu Ishikawa

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 29 ( 3 ) 2022年5月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Partial bacterial genome reduction by genome engineering can improve the productivity of various metabolites, possibly via deletion of non-essential genome regions involved in undesirable metabolic pathways competing with pathways for the desired end products. However, such reduction may cause growth defects. Genome reduction of Bacillus subtilis MGB874 increases the productivity of cellulases and proteases but reduces their growth rate. Here, we show that this growth defect could be restored by silencing redundant or less important genes affecting exponential growth by manipulating the global transcription factor AbrB. Comparative transcriptome analysis revealed that AbrB-regulated genes were upregulated and those involved in central metabolic pathway and synthetic pathways of amino acids and purine/pyrimidine nucleotides were downregulated in MGB874 compared with the wild-type strain, which we speculated were the cause of the growth defects. By constitutively expressing high levels of AbrB, AbrB regulon genes were repressed, while glycolytic flux increased, thereby restoring the growth rate to wild-type levels. This manipulation also enhanced the productivity of metabolites including γ-polyglutamic acid. This study provides the first evidence that undesired features induced by genome reduction can be relieved, at least partly, by manipulating a global transcription regulation system. A similar strategy could be applied to other genome engineering-based challenges aiming toward efficient material production in bacteria.

DOI： 10.1093/dnares/dsac015

PubMed

researchmap
Effectiveness of the Bacillus subtilis genome-reduced strain as an ethanol production host 査読

Dita Grinanda, Takashi Hirasawa

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 86 ( 4 ) 543 - 551 2022年1月

　詳細を見る

担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Informa UK Limited

ABSTRACT

We investigated the performance of a genome-reduced strain of Bacillus subtilis MGB874, whose 0.87 Mbp of genomic DNA was cumulatively deleted, as an ethanol production host. A recombinant strain A267_EtOH was constructed by introducing the pdc and adhB genes from Zymomonas mobilis, both of which were expressed from an isopropyl-β-d-1-thiogalactopyranoside-inducible spac promoter, into the A267 strain, a tryptophan prototrophic derivative of the MGB874 with disruption of metabolic pathways for producing lactic acid, acetic acid, and acetoin. Focusing on the stationary phase in fed-batch fermentation, 1.6 g L−1 ethanol was produced by the A267_EtOH strain after 144 h. Moreover, its ethanol production further increased by approximately 3.7-fold (5.9 g L−1) at 80 h through replacing the spac promoter for expressing pdc and adhB genes with the lytR promoter and the yield was about 112%. These results indicate that the MGB874 is an effective host for ethanol production during the stationary phase.

DOI： 10.1093/bbb/zbac017

researchmap

その他リンク： https://academic.oup.com/bbb/article-pdf/86/4/543/42956449/zbac017.pdf
銅添加によるコリネ型細菌のグルタミン酸生産誘導

平沢敬

バイオサイエンスとインダストリー 80 ( 3 ) 2022年

　詳細を見る

J-GLOBAL

researchmap
Induction of glutamic acid production by copper in Corynebacterium glutamicum 査読

Shunsuke Ogata, Takashi Hirasawa

Applied Microbiology and Biotechnology 105 ( 18 ) 6909 - 6920 2021年9月

　詳細を見る

担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Springer Science and Business Media Deutschland GmbH

DOI： 10.1007/s00253-021-11516-3

Scopus

PubMed

researchmap
13C-metabolic flux analysis in glycerol-assimilating strains of Saccharomyces cerevisiae. 査読

The Journal of General and Applied Microbiology 67 ( 4 ) 142 - 149 2021年5月

　詳細を見る

担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Microbiology Research Foundation

Glycerol is an attractive raw material for the production of useful chemicals using microbial cells. We previously identified metabolic engineering targets for the improvement of glycerol assimilation ability in Saccharomyces cerevisiae based on adaptive laboratory evolution (ALE) and transcriptome analysis of the evolved cells. We also successfully improved glycerol assimilation ability by the disruption of the RIM15 gene encoding a Greatwall protein kinase together with overexpression of the STL1 gene encoding the glycerol/H⁺ symporter. To understand glycerol assimilation metabolism in the evolved glycerol-assimilating strains and STL1-overexpressing RIM15 disruptant, we performed metabolic flux analysis using ¹³C-labeled glycerol. Significant differences in metabolic flux distributions between the strains obtained from the culture after 35 and 85 generations in ALE were not found, indicating that metabolic flux changes might occur in the early phase of ALE (i.e., before 35 generations at least). Similarly, metabolic flux distribution was not significantly changed by RIM15 gene disruption. However, fluxes for the lower part of glycolysis and the TCA cycle were larger and, as a result, flux for the pentose phosphate pathway was smaller in the STL1-overexpressing RIM15 disruptant than in the strain obtained from the culture after 85 generations in ALE. It could be effective to increase flux for the pentose phosphate pathway to improve the glycerol assimilation ability in S. cerevisiae.

DOI： 10.2323/jgam.2020.10.001

PubMed

researchmap
Requirement of the LtsA Protein for Formation of the Mycolic Acid-Containing Layer on the Cell Surface of Corynebacterium glutamicum. 招待査読

Yutaro Kumagai, Takashi Hirasawa, Masaaki Wachi

Microorganisms 2021年2月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The ltsA gene of Corynebacterium glutamicum encodes a purF-type glutamine-dependent amidotransferase, and mutations in this gene result in increased susceptibility to lysozyme. Recently, it was shown that the LtsA protein catalyzes the amidation of diaminopimelate residues in the lipid intermediates of peptidoglycan biosynthesis. In this study, intracellular localization of wild-type and mutant LtsA proteins fused with green fluorescent protein (GFP) was investigated. The GFP-fused wild-type LtsA protein showed a peripheral localization pattern characteristic of membrane-associated proteins. The GFP-fusions with a mutation in the N-terminal domain of LtsA, which is necessary for the glutamine amido transfer reaction, exhibited a similar localization to the wild type, whereas those with a mutation or a truncation in the C-terminal domain, which is not conserved among the purF-type glutamine-dependent amidotransferases, did not. These results suggest that the C-terminal domain is required for peripheral localization. Differential staining of cell wall structures with fluorescent dyes revealed that formation of the mycolic acid-containing layer at the cell division planes was affected in the ltsA mutant cells. This was also confirmed by observation that bulge formation was induced at the cell division planes in the ltsA mutant cells upon lysozyme treatment. These results suggest that the LtsA protein function is required for the formation of a mycolic acid-containing layer at the cell division planes and that this impairment results in increased susceptibility to lysozyme.

DOI： 10.3390/microorganisms9020409

PubMed

researchmap
続・生物工学基礎講座バイオよもやま話コリネ型細菌Corynebacterium glutamicum-グルタミン酸生産の基礎と有用物質生産への応用-

平沢敬

生物工学会誌 99 ( 1 ) 2021年

　詳細を見る

J-GLOBAL

researchmap
Growth promotion in Corynebacterium glutamicum by overexpression of the NCgl2986 gene encoding a protein homologous to peptidoglycan amidases 査読

Mia Fitria Utami, Yoshihiko Matsuda, Ayako Takada, Noritaka Iwai, Takashi Hirasawa, Masaaki Wachi

The Journal of General and Applied Microbiology 66 ( 1 ) 1 - 7 2020年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Microbiology Research Foundation

DOI： 10.2323/jgam.2019.03.002

researchmap
Enhanced L-cysteine production by overexpressing potential L-cysteine exporter genes in an L-cysteine-producing recombinant strain of Corynebacterium glutamicum 査読

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2019年

　詳細を見る

DOI： 10.1080/09168451.2019.1659715

Web of Science

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
L-Cysteine production by metabolically engineered Corynebacterium glutamicum 査読

Applied Microbiology and Biotechnology 2019年

　詳細を見る

担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/S00253-019-09663-9

Web of Science

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
Identification of metabolic engineering targets for improving glycerol assimilation ability of Saccharomyces cerevisiae based on adaptive laboratory evolution and transcriptome analysis 査読

Journal of Bioscience and Bioengineering 2019年

　詳細を見る

DOI： 10.1016/J.JBIOSC.2019.02.001

Web of Science

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
Integrated Analysis of the Transcriptome and Metabolome of Corynebacterium glutamicum during Penicillin-Induced Glutamic Acid Production 査読

Takashi Hirasawa, Masaki Saito, Katsunori Yoshikawa, Chikara Furusawa, Hiroshi Shmizu

Biotechnology Journal 13 ( 5 ) 2018年5月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1002/biot.201700612

Web of Science

Scopus

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
Omics-integrated approach for metabolic state analysis of microbial processes

Hiroshi Shimizu, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, Fumio Matsuda

Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions 213 - 236 2017年1月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：論文集(書籍)内論文出版者・発行元：wiley

DOI： 10.1002/9783527800599.ch7

Scopus

researchmap
Glutamate Fermentation-2: Mechanism of L-Glutamate Overproduction in Corynebacterium glutamicum 査読

Takashi Hirasawa, Masaaki Wachi

AMINO ACID FERMENTATION 159 57 - 72 2017年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/10_2016_26

Web of Science

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
Recent advances in amino acid production by microbial cells 査読

Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY 42 133 - 146 2016年12月

　詳細を見る

記述言語：英語

DOI： 10.1016/j.copbio.2016.04.017

Web of Science

researchmap
Glutamic acid fermentation: Discovery of glutamic acid-producing microorganisms, analysis of the production mechanism, metabolic engineering, and industrial production process 査読

Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

Industrial Biotechnology: Products and Processes 339 - 360 2016年11月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：論文集(書籍)内論文出版者・発行元：Wiley-VCH Verlag

DOI： 10.1002/9783527807833

Scopus

researchmap
Enhancement of 1,5-diaminopentane production in a recombinant strain of Corynebacterium glutamicum by Tween 40 addition 査読

Yuta Matsushima, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF GENERAL AND APPLIED MICROBIOLOGY 62 ( 1 ) 42 - 45 2016年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2323/jgam.62.42

Web of Science

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
Enhanced dipicolinic acid production during the stationary phase in Bacillus subtilis by blocking acetoin synthesis 査読

Yoshihiro Toya, Takashi Hirasawa, Shu Ishikawa, Onuma Chumsakul, Takuya Morimoto, Shenghao Liu, Kenta Masuda, Yasushi Kageyama, Katsuya Ozaki, Naotake Ogasawara, Hiroshi Shimizu

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 79 ( 12 ) 2073 - 2080 2015年12月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1080/09168451.2015.1060843

Web of Science

researchmap
Phenotypic convergence in bacterial adaptive evolution to ethanol stress 査読

Takaaki Horinouchi, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu, Chikara Furusawa

BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY 15 2015年9月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1186/s12862-015-0454-6

Web of Science

researchmap
Effect of malic enzyme on ethanol production by Synechocystis sp PCC 6803 査読

Katsunori Yoshikawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 119 ( 1 ) 82 - 84 2015年1月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2014.06.001

Web of Science

researchmap
Characterization of a Corynebacterium glutamicum dnaB mutant that shows temperature-sensitive growth and mini-cell formation 査読

Makoto Uchida, Takashi Hirasawa, Masaaki Wachi

ARCHIVES OF MICROBIOLOGY 196 ( 12 ) 871 - 879 2014年12月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00203-014-1026-7

Web of Science

researchmap
Integrated Metabolic Flux and Omics Analysis of Synechocystis sp PCC 6803 under Mixotrophic and Photoheterotrophic Conditions 査読

Tsubasa Nakajima, Shuichi Kajihata, Katsunori Yoshikawa, Fumio Matsuda, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 55 ( 9 ) 1605 - 1612 2014年9月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/pcp/pcu091

Web of Science

researchmap
C-13-metabolic flux analysis in heterologous cellulase production by Bacillus subtilis genome-reduced strain 査読

Yoshihiro Toya, Takashi Hirasawa, Takuya Morimoto, Kenta Masuda, Yasushi Kageyama, Katsuya Ozaki, Naotake Ogasawara, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 179 42 - 49 2014年6月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiotec.2014.03.025

Web of Science

researchmap
Increased 3-hydroxypropionic acid production from glycerol, by modification of central metabolism in Escherichia coli 査読

Kento Tokuyama, Satoshi Ohno, Katsunori Yoshikawa, Takashi Hirasawa, Shotaro Tanaka, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

MICROBIAL CELL FACTORIES 13 2014年5月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1186/1475-2859-13-64

Web of Science

researchmap
Glutamic Acid 査読

Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

Bioprocessing of Renewable Resources to Commodity Bioproducts 473 - 495 2014年4月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：論文集(書籍)内論文

DOI： 10.1002/9781118845394.ch17

Web of Science

Scopus

researchmap
Potential of a Saccharomyces cerevisiae recombinant strain lacking ethanol and glycerol biosynthesis pathways in efficient anaerobic bioproduction 査読

Takashi Hirasawa, Yoshihiro Ida, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

BIOENGINEERED 5 ( 2 ) 123 - 128 2014年3月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.4161/bioe.26569

Web of Science

Scopus

PubMed

researchmap
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae to improve succinic acid production based on metabolic profiling 査読

Yuma Ito, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 78 ( 1 ) 151 - 159 2014年1月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1080/09168451.2014.877816

Web of Science

researchmap
Enhanced acetic acid and succinic acid production under microaerobic conditions by Corynebacterium glutamicum harboring Escherichia coli transhydrogenase gene pntAB 査読

Yuto Yamauchi, Takashi Hirasawa, Masato Nishii, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF GENERAL AND APPLIED MICROBIOLOGY 60 ( 3 ) 112 - 118 2014年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2323/jgam.60.112

Web of Science

researchmap
Genome-wide identification of the targets for genetic manipulation to improve l-lactate production by Saccharomyces cerevisiae by using a single-gene deletion strain collection 査読

Takashi Hirasawa, Masakado Takekuni, Katsunori Yoshikawa, Aki Ookubo, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

Journal of Biotechnology 168 ( 2 ) 185 - 193 2013年10月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiotec.2013.04.020

Web of Science

Scopus

PubMed

researchmap
Design of superior cell factories based on systems wide omics analysis 査読

Katsunori Yoshikawa, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

Systems Metabolic Engineering 57 - 81 2013年8月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：論文集(書籍)内論文出版者・発行元：Springer Netherlands

DOI： 10.1007/978-94-007-4534-6_3

Scopus

researchmap
Utilization of Saccharomyces cerevisiae recombinant strain incapable of both ethanol and glycerol biosynthesis for anaerobic bioproduction 査読

Yoshihiro Ida, Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

Applied Microbiology and Biotechnology 97 ( 11 ) 4811 - 4819 2013年6月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00253-013-4760-x

Web of Science

Scopus

PubMed

researchmap
Integrated transcriptomic and metabolomic analysis of the central metabolism of Synechocystis sp PCC 6803 under different trophic conditions 査読

Katsunori Yoshikawa, Takashi Hirasawa, Kenichi Ogawa, Yuki Hidaka, Tsubasa Nakajima, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

BIOTECHNOLOGY JOURNAL 8 ( 5 ) 571 - 580 2013年5月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1002/biot.201200235

Web of Science

researchmap
Systems Metabolic Engineering: The Creation of Microbial Cell Factories by Rational Metabolic Design and Evolution 査読

Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

FUTURE TRENDS IN BIOTECHNOLOGY 131 1 - 23 2013年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/10_2012_137

Web of Science

researchmap
Investigating the effects of perturbations to pgi and eno gene expression on central carbon metabolism in Escherichia coli using C-13 metabolic flux analysis 査読

Yuki Usui, Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Tomokazu Shirai, Natsuko Yamamoto, Hirotada Mori, Hiroshi Shimizu

MICROBIAL CELL FACTORIES 11 2012年6月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1186/1475-2859-11-87

Web of Science

researchmap
Understanding the mechanism of heat stress tolerance caused by high trehalose accumulation in Saccharomyces cerevisiae using DNA microarray 査読

Siraje Arif Mahmud, Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Katsunori Yoshikawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 113 ( 4 ) 526 - 528 2012年4月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2011.11.028

Web of Science

researchmap
Stable disruption of ethanol production by deletion of the genes encoding alcohol dehydrogenase isozymes in Saccharomyces cerevisiae 査読

Yoshihiro Ida, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 113 ( 2 ) 192 - 195 2012年2月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2011.09.019

Web of Science

researchmap
Molecular mechanisms and metabolic engineering of glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum. 査読国際誌

Hirasawa Takashi, Kim Jongpill, Shirai Tomokazu, Furusawa Chikara, Shimizu Hiroshi

Sub-cellular biochemistry 64 261 - 81 2012年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/978-94-007-5055-5_13

PubMed

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
Improving protein secretion of a transglutaminase-secreting Corynebacterium glutamicum recombinant strain on the basis of C-13 metabolic flux analysis 査読

Motoki Umakoshi, Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Yasuhiro Takenaka, Yoshimi Kikuchi, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 112 ( 6 ) 595 - 601 2011年12月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2011.08.011

Web of Science

researchmap
Reconstruction and verification of a genome-scale metabolic model for Synechocystis sp PCC6803 査読

Katsunori Yoshikawa, Yuta Kojima, Tsubasa Nakajima, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 92 ( 2 ) 347 - 358 2011年10月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00253-011-3559-x

Web of Science

researchmap
Investigation of phosphorylation status of OdhI protein during penicillin- and Tween 40-triggered glutamate overproduction by Corynebacterium glutamicum 査読

Jongpill Kim, Takashi Hirasawa, Masaki Saito, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 91 ( 1 ) 143 - 151 2011年7月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00253-011-3275-6

Web of Science

researchmap
Comprehensive phenotypic analysis of single-gene deletion and overexpression strains of Saccharomyces cerevisiae 査読

Katsunori Yoshikawa, Tadamasa Tanaka, Yoshihiro Ida, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

YEAST 28 ( 5 ) 349 - 361 2011年5月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1002/yea.1843

Web of Science

researchmap
Genome-wide expression analysis of Saccharomyces pastorianus orthologous genes using oligonucleotide microarrays 査読

Takaaki Horinouchi, Katsunori Yoshikawa, Risa Kawaide, Chikara Furusawa, Yoshihiro Nakao, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 110 ( 5 ) 602 - 607 2010年11月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2010.05.011

Web of Science

researchmap
Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress 査読

Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu

BMC GENOMICS 11 2010年10月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1186/1471-2164-11-579

Web of Science

researchmap
13C-Metabolic Flux Analysis for Batch Culture of Escherichia coli and Its pyk and pgi Gene Knockout Mutants based on Mass Isotopomer Distribution of Intracellular Metabolites

TOYA Yoshihiro, ISHII Nobuyoshi, NAKAHIGASHI Kenji, HIRASAWA Takashi, SOGA Tomoyoshi, TOMITA Masaru, SHIMIZU Kazuyuki

Biotechnol Prog 26 ( 4 ) 975-992 2010年7月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

researchmap
Saccharomyces cerevisiae and DNA microarray analyses: what did we learn from it for a better understanding and exploitation of yeast biotechnology? 査読

Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 87 ( 2 ) 391 - 400 2010年6月

　詳細を見る

記述言語：英語

DOI： 10.1007/s00253-010-2582-7

Web of Science

researchmap
Requirement of de novo synthesis of the OdhI protein in penicillin-induced glutamate production by Corynebacterium glutamicum 査読

Jongpill Kim, Hirohisa Fukuda, Takashi Hirasawa, Keisuke Nagahisa, Kazuo Nagai, Masaaki Wachi, Hiroshi Shimizu

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 86 ( 3 ) 911 - 920 2010年4月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00253-009-2360-6

Web of Science

researchmap
Differential importance of trehalose accumulation in Saccharomyces cerevisiae in response to various environmental stresses 査読

Siraje Arif Mahmud, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 109 ( 3 ) 262 - 266 2010年3月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiosc.2009.08.500

Web of Science

researchmap
Relationship between noise characteristics in protein expressions and regulatory structures of amino acid biosynthesis pathways 査読

T. Yamada, J. Ou, C. Furusawa, T. Hirasawa, T. Yomo, H. Shimizu

IET SYSTEMS BIOLOGY 4 ( 1 ) 82 - 89 2010年1月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1049/iet-syb.2008.0158

Web of Science

researchmap
Investigating the effectiveness of DNA microarray analysis for identifying the genes involved in l-lactate production by Saccharomyces cerevisiae 査読

Takashi Hirasawa, Aki Ookubo, Katsunori Yoshikawa, Keisuke Nagahisa, Chikara Furusawa, Hideki Sawai, Hiroshi Shimizu

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 84 ( 6 ) 1149 - 1159 2009年10月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00253-009-2209-z

Web of Science

researchmap
Analysis of adaptation to high ethanol concentration in Saccharomyces cerevisiae using DNA microarray 査読

Thai Nho Dinh, Keisuke Nagahisa, Katsunori Yoshikawa, Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

BIOPROCESS AND BIOSYSTEMS ENGINEERING 32 ( 5 ) 681 - 688 2009年8月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00449-008-0292-7

Web of Science

researchmap
Development and experimental verification of a genome-scale metabolic model for Corynebacterium glutamicum 査読

Yohei Shinfuku, Natee Sorpitiporn, Masahiro Sono, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

MICROBIAL CELL FACTORIES 8 2009年8月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1186/1475-2859-8-43

Web of Science

researchmap
Proteomic analysis of responses to osmotic stress in laboratory and sake-brewing strains of Saccharomyces cerevisiae 査読

Takashi Hirasawa, Kazuyuki Yamada, Keisuke Nagahisa, Thai Nho Dinh, Chikara Furusawa, Yoshio Katakura, Suteaki Shioya, Hiroshi Shimizu

PROCESS BIOCHEMISTRY 44 ( 6 ) 647 - 653 2009年6月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.procbio.2009.02.004

Web of Science

researchmap
Comprehensive phenotypic analysis for identification of genes affecting growth under ethanol stress in Saccharomyces cerevisiae 査読

Katsunori Yoshikawa, Tadamasa Tanaka, Chikara Furusawa, Keisuke Nagahisa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

FEMS YEAST RESEARCH 9 ( 1 ) 32 - 44 2009年2月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1111/j.1567-1364.2008.00456.x

Web of Science

researchmap
Effect of trehalose accumulation on response to saline stress in Saccharomyces cerevisiae 査読

Siraje Arif Mahmud, Keisuke Nagahisa, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Kengo Ashitani, Hiroshi Shimizu

YEAST 26 ( 1 ) 17 - 30 2009年1月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1002/yea.1646

Web of Science

researchmap
Effect of odhA overexpression and odhA antisense RNA expression on Tween-40-triggered glutamate production by Corynebacterium glutamicum. 査読

Kim J, Hirasawa T, Sato Y, Nagahisa K, Furusawa C, Shimizu H

Applied microbiology and biotechnology 81 ( 6 ) 1097 - 1106 2009年1月

　詳細を見る

出版者・発行元：6

DOI： 10.1007/s00253-008-1743-4

PubMed

researchmap
Genome-wide Analysis of the Effects of Location and Number of Stress Response Elements on Gene Expression in Saccharomyces cerevisiae 査読

Katsunori Yoshikawa, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 106 ( 5 ) 507 - 510 2008年11月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1263/jbb.106.507

Web of Science

researchmap
Improvement of L-Lactate Production by CYB2 Gene Disruption in a Recombinant Saccharomyces cerevisiae Strain under Low pH Condition 査読

Aki Ookubo, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Keisuke Nagahisa, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 72 ( 11 ) 3063 - 3066 2008年11月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1271/bbb.80493

Web of Science

researchmap
Comprehensive phenotypic analysis of yeast under ethanol stress condition 査読

Katsunori Yoshikawa, Tadamasa Tanaka, Chikara Furusawa, Keisuke Nagahisa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu

JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136 S111 - S111 2008年10月

　詳細を見る

記述言語：英語

DOI： 10.1016/j.jbiotec.2008.07.014

Web of Science

researchmap
Distinct roles of two anaplerotic pathways in glutamate production induced by biotin limitation in Corynebacterium glutamicum 査読

Hiroki Sato, Keita Orishimo, Tomokazu Shirai, Takashi Hirasawa, Keisuke Nagahisa, Hiroshi Shimizu, Masaaki Wachi

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 106 ( 1 ) 51 - 58 2008年7月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1263/jbb.106.51

Web of Science

researchmap
Adaptation of Saccharomyces cerevisiae Cells to High Ethanol Concentration and Changes in Fatty Acid Composition of Membrane and Cell Size 査読

Thai Nho Dinh, Keisuke Nagahisa, Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu

PLOS ONE 3 ( 7 ) 2008年7月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1371/journal.pone.0002623

Web of Science

researchmap
Dynamic change in promoter activation during lysine biosynthesis in Escherichia coli cells 査読

Jianhong Ou, Tadashi Yamada, Keisuke Nagahisa, Takashi Hirasawa, Chikara Furusawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu

MOLECULAR BIOSYSTEMS 4 ( 2 ) 128 - 134 2008年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1039/b711035a

Web of Science

researchmap
Metabolic flux balance analysis of an industrially useful microorganism corynebacerium glutamicum by a genome-scale reconstructed model

Hiroshi Shimizu, Yohei Shinfuku, Masahiro Sono, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa

3rd International ICST Conference on Bio-Inspired Models of Network, Information and Computing Systems, BIONETICS 2008 2008年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）出版者・発行元：ICST

DOI： 10.4108/icst.bionetics2008.4704

Scopus

researchmap
Identification of target genes conferring ethanol stress tolerance to Saccharomyces cerevisiae based on DNA microarray data analysis 査読

Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yuki Nakakura, Keisuke Nagahisa, Chikara Furusawa, Yoshio Katakura, Hiroshi Shimizu, Suteaki Shioya

JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 131 ( 1 ) 34 - 44 2007年8月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.jbiotec.2007.05.010

Web of Science

researchmap
Metabolic pathway recruiting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae 査読

Suteaki Shioya, Hiroshi Shimizu, Takashi Hirasawa, Keisuke Nagahisa, Chikara Furusawa, Gaurav Pandey, Yoshio Katakura

BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL 36 ( 1 ) 28 - 37 2007年8月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.bej.2006.06.012

Web of Science

researchmap
Direct measurement of isotopomer of intracellular metabolites using capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry for efficient metabolic flux analysis 査読

Yoshihiro Toya, Nobuyoshi Ishii, Takashi Hirasawa, Miki Naba, Kenta Hirai, Kaori Sugawara, Saori Igarashi, Kazuyuki Shimizu, Masaru Tomita, Tomoyoshi Soga

JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A 1159 ( 1-2 ) 134 - 141 2007年8月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.chroma.2007.04.011

Web of Science

PubMed

researchmap
Extracting the hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA microarray data using the self-organizing map: biosynthesis of amino acids 査読

Gaurav Pandey, Katsunori Yoshikawa, Takashi Hirasawa, Keisuke Nagahisa, Yoshio Katakura, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Suteaki Shioya

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 75 ( 2 ) 415 - 426 2007年5月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00253-007-0837-8

Web of Science

researchmap
Multiple high-throughput analyses monitor the response of E-coli to perturbations 査読

Nobuyoshi Ishii, Kenji Nakahigashi, Tomoya Baba, Martin Robert, Tomoyoshi Soga, Akio Kanai, Takashi Hirasawa, Miki Naba, Kenta Hirai, Aminul Hoque, Pei Yee Ho, Yuji Kakazu, Kaori Sugawara, Saori Igarashi, Satoshi Harada, Takeshi Masuda, Naoyuki Sugiyama, Takashi Togashi, Miki Hasegawa, Yuki Takai, Katsuyuki Yugi, Kazuharu Arakawa, Nayuta Iwata, Yoshihiro Toya, Yoichi Nakayama, Takaaki Nishioka, Kazuyuki Shimizu, Hirotada Mori, Masaru Tomita

SCIENCE 316 ( 5824 ) 593 - 597 2007年4月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1126/science.1132067

Web of Science

researchmap
Inverse metabolic engineering by integration of multiple omics analyses

Hiroshi Shimizu, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yuki Nakakura, Keisuke Nagahisa, Chikara Furusawa, Yoshio Katakura, Suteaki Shioya

IFAC Proceedings Volumes (IFAC-PapersOnline) 10 19 - 24 2007年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）出版者・発行元：IFAC Secretariat

DOI： 10.3182/20070604-3-mx-2914.00005

Scopus

researchmap
Production of glutamate and glutamate-related amino acids: Molecular mechanism analysis and metabolic engineering 招待査読

Hiroshi Shimizu, Takashi Hirasawa

Microbiology Monograph 5 1 - 38 2007年

　詳細を見る

記述言語：英語

researchmap
Comparison of transcriptional responses to osmotic stresses induced by NaCl and sorbitol additions in Saccharomyces cerevisiae using DNA microarray 査読

Takashi Hirasawa, Kengo Ashitani, Katsunori Yoshikawa, Keisuke Nagahisa, Chikara Furusawa, Yoshio Katakura, Hiroshi Shimizu, Suteaki Shioya

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 102 ( 6 ) 568 - 571 2006年12月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1263/jbb.102.568

Web of Science

researchmap
Comparative analysis of transcriptional responses to saline stress in the laboratory and brewing strains of Saccharomyces cerevisiae with DNA microarray 査読

T Hirasawa, Y Nakakura, K Yoshikawa, K Ashitani, K Nagahisa, C Furusawa, Y Katakura, H Shimizu, S Shioya

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 70 ( 3 ) 346 - 357 2006年4月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00253-005-0192-6

Web of Science

researchmap
Fluorescent phospholipid analogs as microscopic probes for detection of the mycolic acid-containing layer in Corynebacterium glutamicum: Detecting alterations in the mycolic acid-containing layer following ethambutol treatment 査読

Y Kumagai, T Hirasawa, K Hayakawa, K Nagai, M Wachi

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 69 ( 11 ) 2051 - 2056 2005年11月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1271/bbb.69.2051

Web of Science

researchmap
DNA microarray analysis on Saccharomyces cerevisiae under high carbon dioxide concentration in fermentation process 査読

K Nagahisa, T Nakajima, K Yoshikawa, T Hirasawa, Y Katakura, C Furusawa, S Shioya, H Shimizu

BIOTECHNOLOGY AND BIOPROCESS ENGINEERING 10 ( 5 ) 451 - 461 2005年9月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Web of Science

researchmap
Analysis of responses of complex bionetworks to changes in environmental conditions 査読

H Shimizu, T Hirasawa, K Nagahisa, S Shioya

BIOLOGICALLY INSPIRED APPROACHES TO ADVANCED INFORMATION TECHNOLOGY 3141 13 - 27 2004年

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Web of Science

researchmap
A Corynebacterium glutamicum rnhA recG double mutant showing lysozymesensitivity, temperature-sensitive growth, and UV-sensitivity 査読

T Hirasawa, Y Kumagai, K Nagai, M Wachi

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 67 ( 11 ) 2416 - 2424 2003年11月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1271/bbb.67.2416

Web of Science

researchmap
kdsA mutations affect FtsZ-ring formation in Escherichia coli K-12 査読

H Fujishima, A Nishimura, M Wachi, H Takagi, T Hirasawa, H Teraoka, K Nishimori, T Kawabata, K Nishikawa, K Nagai

MICROBIOLOGY-SGM 148 103 - 112 2002年1月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1099/00221287-148-1-103

Web of Science

researchmap
L-glutamate production by lysozyme-sensitive Corynebacterium glutamicum ItsA mutant strains 査読

Takashi Hirasawa, Masaaki Wachi, Kazuo Nagai

BMC Biotechnology 1 9 2001年10月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1186/1472-6750-1-9

Scopus

PubMed

researchmap

その他リンク： http://orcid.org/0000-0002-5183-2953
A mutation in the Corynebacterium glutamicum ItsA gene causes susceptibility to lysozyme, temperature-sensitive growth, and L-glutamate production 査読

T Hirasawa, M Wachi, K Nagai

JOURNAL OF BACTERIOLOGY 182 ( 10 ) 2696 - 2701 2000年5月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1128/JB.182.10.2696-2701.2000

Web of Science

researchmap
fcsA29 mutation is an allele of polA gene of Escherichia coli 査読

K Nagano, M Wachi, A Takada, F Takaku, T Hirasawa, K Nagai

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 63 ( 2 ) 427 - 429 1999年2月

　詳細を見る

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1271/bbb.63.427

Web of Science

researchmap

▼全件表示

書籍等出版物

バイオテクノロジーシリーズ微生物を活用した有用物質の製造技術

平沢敬（担当：分担執筆範囲: 第7章食品素材の生産 1. コリネ型細菌Corynebacterium glutamicumによるアミノ酸の発酵生産：L-グルタミン酸の直接発酵とアミノ酸生産株の育種）

シーエムシー出版 2023年5月

　詳細を見る

researchmap
ベーシックマスター生化学

平沢敬（担当：分担執筆範囲: 第9章クエン酸回路と電子伝達系）

オーム社 2008年

　詳細を見る

researchmap

講演・口頭発表等

出芽酵母を宿主としたcis, cis-ムコン酸の生産

小圷玲子, 平沢敬

日本農芸化学会2025年度大会 2025年3月

　詳細を見る

開催年月日： 2025年3月

記述言語：日本語会議種別：ポスター発表

researchmap
コリネ型細菌Corynebacterium glutamicumにおけるodhI遺伝子の発現量増加とグルタミン酸生産の関係

宮内翼, 平沢敬

第76回日本生物工学会大会 2024年9月

　詳細を見る

開催年月日： 2024年9月

記述言語：日本語会議種別：口頭発表（一般）

researchmap
コリネ型細菌の適応実験室進化による人工代謝経路の増強とメカニズムの解明

井口元太, 山本啓介, 平沢敬

第76回日本生物工学会大会 2024年9月

　詳細を見る

開催年月日： 2024年9月

記述言語：日本語会議種別：口頭発表（一般）

researchmap
出芽酵母におけるCrabtree効果の抑制に関する研究

渡邉莉歩, 平沢敬

第22回微生物研究会 2024年11月

　詳細を見る

記述言語：日本語会議種別：ポスター発表

researchmap
コリネ型細菌Corynebacterium glutamicumによるイソプレン生産に向けた代謝改変

齋藤拳斗, 平沢敬

日本農芸化学会関東支部2024年度大会 2024年8月

　詳細を見る

記述言語：日本語会議種別：口頭発表（一般）

researchmap
出芽酵母の代謝改変によるcis,cis-ムコン酸の生産

小圷玲子, 平沢敬

第22回微生物研究会 2024年11月

　詳細を見る

記述言語：日本語会議種別：ポスター発表

researchmap
コリネ型細菌のO-アセチルホモセリン生産株の育種

小又健人, 平沢敬

第22回微生物研究会 2024年11月

　詳細を見る

記述言語：日本語会議種別：ポスター発表

researchmap

▼全件表示

受賞

日本生物工学会第１９回生物工学論文賞

2011年9月日本生物工学会 Differential importance of trehalose accumulation in Saccharomyces cerevisiae in response to various environmental stresses

Siraje Arif Mahmud, 平沢敬, 清水浩

　詳細を見る

researchmap
第８回鎌田泉博士論文賞

2002年3月

平沢敬

　詳細を見る

researchmap

共同研究・競争的資金等の研究課題

出芽酵母におけるグリセロール資化の新規メカニズム解明と有用物質発酵生産への応用

2023年4月 - 2025年3月

公益財団法人小林財団第１１回（令和４年度）研究助成

　詳細を見る

担当区分：研究代表者

researchmap
人工代謝経路を利用したO-アセチルホモセリン微生物発酵生産の高効率化

2022年 - 2023年

科学技術振興機構産学が連携した研究開発成果の展開研究成果展開事業研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP) トライアウトトライアウト

平沢敬

　詳細を見る

担当区分：研究代表者

本研究では、細胞の環境適応・進化機構に基づいて、微生物に導入した人工代謝経路の代謝フラックス強化を実現させる。そして、フラックスが強化された人工代謝経路の反応を利用することで、アミノ酸の一種であるメチオニンの工業的生産における出発物質であるO-アセチルホモセリンの微生物による発酵生産を高効率化する。

researchmap

J-GLOBAL
進化工学によるメチルトランスフェラーゼ反応フラックスの強化と抗酸化能を持つエルゴチオネインの微生物発酵生産系への応用

2021年4月 - 2022年3月

公益財団法人小柳財団 2020年度研究助成

　詳細を見る

担当区分：研究代表者

researchmap
使用済タイヤ（廃ゴム）からの化学品製造技術の開発

研究課題/領域番号：21578630 2021年 - 2028年3月

国立研究開発法人新エネルギー・産業技術総合開発機構グリーンイノベーション基金事業・ＣＯ２等を用いたプラスチック原料製造技術開発／研究開発項目2「廃プラ・廃ゴムからの化学品製造技術の開発」

　詳細を見る

担当区分：研究分担者

researchmap
実験室進化を基盤とするコリネ型細菌システイン耐性株の創製と含硫有用物質生産への応用

2018年4月 - 2019年3月

公益財団法人すかいらーくフードサイエンス研究所第31回学術助成

　詳細を見る

担当区分：研究代表者

researchmap
定常期における有用物質生産に向けた微生物の細胞増殖・代謝を制御する化合物の探索

2016年4月 - 2019年3月

日本学術振興会科研費挑戦的萌芽研究

平沢敬

　詳細を見る

担当区分：研究代表者資金種別：競争的資金

researchmap
炭素・窒素・硫黄メタボリックフローの統合的改変育種によるエルゴチオネイン発酵生産

2015年4月 - 2018年3月

農林水産省農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業委託事業

大津厳生

　詳細を見る

資金種別：競争的資金

researchmap
実験進化過程のマルチオミクス解析によるストレス耐性細胞工場の創製

2012年4月 - 2016年3月

日本学術振興会科研費基盤研究(A)

清水浩

　詳細を見る

資金種別：競争的資金

researchmap
汎用的高効率バイオプロセス細胞の創製

2011年3月 - 2016年3月

科学技術振興機構先端的低炭素化技術開発

小笠原直毅

　詳細を見る

資金種別：競争的資金

researchmap
微細藻類の光阻害とストレス適応メカニズムの解析

研究課題/領域番号：23656526 2011年 - 2012年

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究

清水浩, 古澤力, 平沢敬

　詳細を見る

配分額：3900000円（直接経費：3000000円、間接経費：900000円）

本研究では、微細藻類Synechocystissp. PCC 6803を用いて光強度と増殖の関係を調査し、強度の大きい光に対して耐性を示し増殖能、物質生産能の高い株を育種するための戦略を探ることを目的とした。光強度に対して増殖速度が変化することを定量的に捉えることに成功した。また遺伝子発現量をDNAマイクロアレイにより網羅的に解析した。これらの解析から今後、強い光に対して耐性を有する細胞を創製する戦術を立てることが可能となると期待される。

researchmap
全ゲノム一塩基レベル変異解析に基づくストレス耐性細胞の創製

研究課題/領域番号：21360401 2009年 - 2011年

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

清水浩, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮

　詳細を見る

配分額：17550000円（直接経費：13500000円、間接経費：4050000円）

本研究においては、進化工学に基づき長期植え継ぎ培養を行って、5%濃度のエタノールに耐性を示す大腸菌の細胞6株を取得した。DNAマイクロアレイを用いてストレス耐性株と親株の遺伝子発現量を網羅的に比較した。全ての遺伝子の発現量データを主成分解析したところ、ストレスに耐性を示す株は共通的にアミノ酸合成に関与する遺伝子の発現量が特徴的に変化していることが確認された。培地中にこの遺伝子発現変化に基づくアミノ酸を添加したところ、ストレス環境下において、増殖速度が大きくなることが示された。また、全ゲノム一塩基レベルの変異解析を行ったところ変異の数は大きくなくまた独立に得られた進化株に共通性がないことなどから、変異のストレス耐性への寄与は大きくないことが示唆された。

researchmap
アンチセンスRNA発現系を用いた微生物代謝改変技術の最適化

研究課題/領域番号：21780071 2009年 - 2010年

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B)

平沢敬

　詳細を見る

配分額：4550000円（直接経費：3500000円、間接経費：1050000円）

本研究では、コリネ型細菌Corynebacterium glutamicumのodhA遺伝子mRNAに対するアンチセンスRNA発現系を例に、アンチセンスRNA発現系が微生物代謝改変技術として利用可能であるのかを検討した。また、長さの異なるアンチセンスRNAの設計や標的mRNAの構造に基づく設計を行うことで、代謝改変を行うために有効なアンチセンスRNAを設計することができるのか検討し、アンチセンスRNA発現系の最適化を試みた。

researchmap
代謝制御機構の理解と有用菌株デザインに向けた大腸菌の代謝ダイナミクス解析

研究課題/領域番号：19780061 2007年 - 2008年

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B)

平沢敬

　詳細を見る

配分額：3690000円（直接経費：3300000円、間接経費：390000円）

本研究では、代謝制御機構の理解と産業上有用とされる化合物を生産する有用菌株デザインを目的として、大腸菌の細胞内の代謝のダイナミックな変化を代謝フラックス分布の変化からとらえることを目的とした。
生物の代謝は、遺伝子発現レベルでさまざまなタンパク質により制御を受けていることが知られている。代謝制御に関わるタンパク質の遺伝子を欠損させた細胞を培養することで、親株とは異なる細胞内酵素濃度組成になった状態の細胞が得られると予想される。そこで、大腸菌の野生株および細胞内代謝を制御するタンパク質をコードする遺伝子の欠損株を培養し、代謝の変化を測定した。また、野生株をさまざまな酸素レベルの状態で連続培養を行い、代謝フラックスの変化を解析した。さらには、細胞内遊離のアミノ酸についての分析データから、代謝フラックス分布を決定する手法の開発を試みた。
本研究により確立された手法を有機酸などの有用物質を生産する菌株に適用させることにより、微生物を用いた有用物質生産においてさらなる生産性向上を目指した育種の指針を導出することができると期待される。

researchmap
酵母による環境調和型化学物質生産を目的とした代謝経路のインシリコデザイン

研究課題/領域番号：18360395 2006年 - 2007年

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

清水浩, 古澤力, 平沢敬, 永久圭介

　詳細を見る

配分額：17130000円（直接経費：15600000円、間接経費：1530000円）

本研究においては、有用化学物質の微生物生産を目的として、ゲノムスケールの代謝反応情報を化学量論式によりモデル化し、微生物の代謝をインシリコデザインすることを目的とした。出芽酵母のゲノム情報を基盤として遺伝子発現量の変化が標的生産物質の生産フラックスに与える影響についてコンピュータで予測する手法を開発した。
ゲノムスケールで代謝情報を化学量論式の形で集積し、代謝反応モデルを開発するための検討を行った。このモデル開発では、パラメータ推定が困難な動力学的情報を一切含まず、モデル化の労力を最小限にすることを念頭に行った。解糖経路、TCAサイクル、アミノ酸の合成経路など中枢代謝経路周辺を中心とした化学物質を標的化合物に設定し、遺伝子改変の代謝ネットワークに与える変動の効果を予測するためのモデル構築の検討を行った。一遺伝子破壊の条件を与え、遺伝子破壊による代謝フラックス変化を予測する方法を開発した。
一方、代謝変動が実際に有効に起こるかどうかを実験的に検証するための手法開発も行った。ここでは、高精度中枢代謝経路評価システムの開発に分けて研究を進めた。酵母に13C同位体標識化合物を細胞内に取り込ませる実を行うとともに、中枢代謝経路の変換過程で、代謝物質の炭素原子が変換前後でどの炭素に移動するかということを考慮した精密な原子マッピングモデルと構築した。代謝反応において取り込まれた標識炭素が、どのように変換されていくかを解析するモデルを構築し実際の細胞を使って評価を行った。
本研究により目的物質の効率的生産に向けた代謝のインシリコ予測、評価を行えるシステム開発の基礎が確立した。

researchmap

▼全件表示

担当経験のある科目（授業）

環境安全論

2024年4月 - 現在機関名：東京科学大学 / 東京工業大学

　詳細を見る

researchmap
生物代謝科学

2016年4月 - 現在機関名：東京科学大学 / 東京工業大学

　詳細を見る

researchmap
生命理工学基礎実験・演習

2016年4月 - 現在機関名：東京科学大学 / 東京工業大学

　詳細を見る

researchmap
生物化学工学

2016年4月 - 現在機関名：東京科学大学 / 東京工業大学

　詳細を見る

researchmap
微生物学

2016年4月 - 現在機関名：東京科学大学 / 東京工業大学

　詳細を見る

researchmap
微生物工学

2014年 - 2015年機関名：東京工業大学

　詳細を見る

researchmap
基礎生物学

2014年 - 2015年機関名：東京工業大学

　詳細を見る

researchmap
生物化学

2013年 - 2015年機関名：東京工業大学

　詳細を見る

researchmap

▼全件表示